RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577498.1

IFT20-204, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 4

Gene IFT20, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-204ENST00000577498 A2MP01023 1474 aa22.02■■□□□ 1.12
IFT20-204ENST00000577498 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.01■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 DEPDC5O75140 1603 aa22.01■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 SIN3AQ96ST3 1273 aa22■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 ABCA6Q8N139 1617 aa21.99■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 PKD2Q13563 968 aa21.98■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.97■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.97■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 NEUROD1Q13562 356 aa21.96■■□□□ 1.11
IFT20-204ENST00000577498 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 KANK1Q14678 1352 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.94■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 KIF3BO15066 747 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 FOXD1Q16676 465 aa21.93■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.13e-6■■□□□ 11.7
IFT20-204ENST00000577498 TONSLQ96HA7 1378 aa21.91■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.91■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.9■■□□□ 1.1
IFT20-204ENST00000577498 REREQ9P2R6 1566 aa21.89■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 ATP10AO60312 1499 aa21.88■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 TET3O43151 1660 aa21.87■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.85■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.83■■□□□ 1.09
IFT20-204ENST00000577498 AGLP35573 1532 aa21.82■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 E9PCH4 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 PLA2R1Q13018 1463 aa21.78■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.78■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 PTPRTO14522 1441 aa21.77■■□□□ 1.08
IFT20-204ENST00000577498 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.76■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 ABCC3O15438 1527 aa21.75■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 GGT6Q6P531 493 aa21.74■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.74■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 CEP152O94986 1710 aa21.74■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 TRPM2O94759 1503 aa21.74■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.73■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.72■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.71■■□□□ 1.07
IFT20-204ENST00000577498 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.69■■□□□ 1.06
IFT20-204ENST00000577498 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.68■■□□□ 1.06
IFT20-204ENST00000577498 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
IFT20-204ENST00000577498 NPATQ14207 1427 aa21.65■■□□□ 1.06
IFT20-204ENST00000577498 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.64■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 CLTCL1P53675 1640 aa21.62■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 NOS1P29475 1434 aa21.6■■□□□ 1.05
IFT20-204ENST00000577498 STAC3Q96MF2 364 aa21.56■■□□□ 1.04
IFT20-204ENST00000577498 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.55■■□□□ 1.04
IFT20-204ENST00000577498 KIF1BO60333 1816 aa21.52■■□□□ 1.04
IFT20-204ENST00000577498 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.52■■□□□ 1.04
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IFT20-204ENST00000577498 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 PIK3C2BO00750 1634 aa21.51■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 SYNMO15061 1565 aa21.5■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.5■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.5■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.49■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 ADGRB3O60242 1522 aa21.49■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 ERVK-7P63135 1459 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 MLECQ14165 292 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.46■■□□□ 1.03
IFT20-204ENST00000577498 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.45■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 MROH2AA6NES4 1674 aa21.44■■□□□ 1.02
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IFT20-204ENST00000577498 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 MYOM2P54296 1465 aa21.43■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 ZMYM3Q14202 1370 aa21.42■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.42■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.41■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 IFT172Q9UG01 1749 aa21.4■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 MADDQ8WXG6 1647 aa21.4■■□□□ 1.02
IFT20-204ENST00000577498 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.38■■□□□ 1.01
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IFT20-204ENST00000577498 IDI1Q13907 227 aa21.38■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 LAMC1P11047 1609 aa21.37■■□□□ 1.01
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IFT20-204ENST00000577498 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 PPLO60437 1756 aa21.35■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.35■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.34■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.34■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 USP47Q96K76 1375 aa21.34■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.33■■□□□ 1.01
IFT20-204ENST00000577498 TNRQ92752 1358 aa21.31■■□□□ 1
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