RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-217	ENST00000576589	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.33	■■■■■ 4.53
NOMO3-217	ENST00000576589	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.32	■■■■■ 4.53
NOMO3-217	ENST00000576589	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.3	■■■■■ 4.52
NOMO3-217	ENST00000576589	ZMYM3	Q14202	1370 aa		43.29	■■■■■ 4.52
NOMO3-217	ENST00000576589	STRC	Q7RTU9	1775 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NOMO3-217	ENST00000576589	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NOMO3-217	ENST00000576589	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NOMO3-217	ENST00000576589	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.18	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.18	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	MROH2A	A6NES4	1674 aa		43.17	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		43.14	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.14	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	ADGRL2	O95490	1459 aa		43.13	■■■■■ 4.5
NOMO3-217	ENST00000576589	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.13	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	PTPRT	O14522	1441 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	NPAT	Q14207	1427 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	PTPRK	Q15262	1439 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.11	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.1	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	ITGAE	P38570	1179 aa		43.08	■■■■■ 4.49
NOMO3-217	ENST00000576589	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	43.04	■■■■■ 4.48
NOMO3-217	ENST00000576589	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.99	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.98	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.96	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	ABCC3	O15438	1527 aa		42.96	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.95	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.95	■■■■■ 4.47
NOMO3-217	ENST00000576589	PZP	P20742	1482 aa		42.94	■■■■■ 4.46
NOMO3-217	ENST00000576589	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		42.92	■■■■■ 4.46
NOMO3-217	ENST00000576589	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
NOMO3-217	ENST00000576589	KANK1	Q14678	1352 aa		42.9	■■■■■ 4.46
NOMO3-217	ENST00000576589	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
NOMO3-217	ENST00000576589	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		42.85	■■■■■ 4.45
NOMO3-217	ENST00000576589	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.84	■■■■■ 4.45
NOMO3-217	ENST00000576589	TNR	Q92752	1358 aa		42.84	■■■■■ 4.45
NOMO3-217	ENST00000576589	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.82	■■■■■ 4.45
NOMO3-217	ENST00000576589	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.81	■■■■■ 4.44
NOMO3-217	ENST00000576589	CEP152	O94986	1710 aa		42.77	■■■■■ 4.44
NOMO3-217	ENST00000576589	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
NOMO3-217	ENST00000576589	PKD2	Q13563	968 aa		42.76	■■■■■ 4.44
NOMO3-217	ENST00000576589	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
NOMO3-217	ENST00000576589	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.74	■■■■■ 4.43
NOMO3-217	ENST00000576589	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.72	■■■■■ 4.43
NOMO3-217	ENST00000576589	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.72	■■■■■ 4.43
NOMO3-217	ENST00000576589	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.7	■■■■■ 4.43
NOMO3-217	ENST00000576589	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.69	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.69	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.68	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.66	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.63	■■■■■ 4.42
NOMO3-217	ENST00000576589	UNC13B	O14795	1591 aa		42.57	■■■■■ 4.41
NOMO3-217	ENST00000576589	NAIP	Q13075	1403 aa		42.55	■■■■■ 4.4
NOMO3-217	ENST00000576589	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.54	■■■■■ 4.4
NOMO3-217	ENST00000576589	NUP155	O75694	1391 aa		42.53	■■■■■ 4.4
NOMO3-217	ENST00000576589	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
NOMO3-217	ENST00000576589	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.49	■■■■■ 4.39
NOMO3-217	ENST00000576589	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.48	■■■■■ 4.39
NOMO3-217	ENST00000576589	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.47	■■■■■ 4.39
NOMO3-217	ENST00000576589	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
NOMO3-217	ENST00000576589	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.43	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.43	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	TET3	O43151	1660 aa		42.43	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	NOS1	P29475	1434 aa		42.43	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.41	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.38	■■■■■ 4.38
NOMO3-217	ENST00000576589	IDI1	Q13907	227 aa		42.38	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.37	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	SYNM	O15061	1565 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.33	■■■■■ 4.37
NOMO3-217	ENST00000576589	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.32	■■■■■ 4.36
NOMO3-217	ENST00000576589	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.3	■■■■■ 4.36
NOMO3-217	ENST00000576589	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.3	■■■■■ 4.36
NOMO3-217	ENST00000576589	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.26	■■■■■ 4.36
NOMO3-217	ENST00000576589		E9PCH4	1651 aa		42.25	■■■■■ 4.35
NOMO3-217	ENST00000576589	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.25	■■■■■ 4.35
NOMO3-217	ENST00000576589	CPS1	P31327	1500 aa		42.2	■■■■■ 4.35
NOMO3-217	ENST00000576589	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.2	■■■■■ 4.35
NOMO3-217	ENST00000576589	MED14	O60244	1454 aa		42.18	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.17	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.16	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.16	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	SLIT1	O75093	1534 aa		42.15	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.15	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	LTK	P29376	864 aa		42.14	■■■■■ 4.34
NOMO3-217	ENST00000576589	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.11	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	TOM1	O60784	492 aa		42.1	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.1	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
NOMO3-217	ENST00000576589	SOCS7	O14512	581 aa		42.06	■■■■■ 4.32
NOMO3-217	ENST00000576589	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.06	■■■■■ 4.32
NOMO3-217	ENST00000576589	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.03	■■■■■ 4.32

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