RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	HECW1	Q76N89	1606 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ABCA8	O94911	1581 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	NEO1	Q92859	1461 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TSC1	Q92574	1164 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	KANK1	Q14678	1352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ADGRL2	O95490	1459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	PBRM1	Q86U86	1689 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CAPN15	O75808	1086 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	RAD21	O60216	631 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	FOXD1	Q16676	465 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	APBB1	O00213	710 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	NEFM	P07197	916 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	GGT6	Q6P531	493 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ADGRL1	O94910	1474 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	ZBTB22	O15209	634 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588		G3V3G9	751 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	FANCA	O15360	1455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	STK25	O00506	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MKL2-206	ENST00000572588	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.09	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RNF40	O75150	1001 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	STK24	Q9Y6E0	443 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	NEFL	P07196	543 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PTMS	P20962	102 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	A2M	P01023	1474 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ATP10A	O60312	1499 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RGL3	Q3MIN7	710 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	RFX1	P22670	979 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PSMD1	Q99460	953 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PTPRT	O14522	1441 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	MLEC	Q14165	292 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PZP	P20742	1482 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.03	□□□□□ -1.76
MKL2-206	ENST00000572588	PLA2R1	Q13018	1463 aa		4.03	□□□□□ -1.77

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