RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570253.5

PKD1-240, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-240	ENST00000570253	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PKD1-240	ENST00000570253	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PKD1-240	ENST00000570253	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PKD1-240	ENST00000570253	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PKD1-240	ENST00000570253	TNR	Q92752	1358 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PKD1-240	ENST00000570253	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PKD1-240	ENST00000570253	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
PKD1-240	ENST00000570253	PZP	P20742	1482 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PKD1-240	ENST00000570253	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
PKD1-240	ENST00000570253	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
PKD1-240	ENST00000570253	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PKD1-240	ENST00000570253	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PKD1-240	ENST00000570253	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PKD1-240	ENST00000570253	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PKD1-240	ENST00000570253	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	CPS1	P31327	1500 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.22	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PKD1-240	ENST00000570253	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	SOCS7	O14512	581 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.18	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	TOM1	O60784	492 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	ABCC3	O15438	1527 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	APLP2	Q06481	763 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.14	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
PKD1-240	ENST00000570253	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PKD1-240	ENST00000570253	MED14	O60244	1454 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PKD1-240	ENST00000570253	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PKD1-240	ENST00000570253	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PKD1-240	ENST00000570253	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PKD1-240	ENST00000570253	CEP152	O94986	1710 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PKD1-240	ENST00000570253	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PKD1-240	ENST00000570253	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PKD1-240	ENST00000570253	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PKD1-240	ENST00000570253	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	KANK1	Q14678	1352 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	HSPA1L	P34931	641 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PKD1-240	ENST00000570253	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	ABCC5	O15440	1437 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.93	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.92	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	SYNM	O15061	1565 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	DAPK1	P53355	1430 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PKD1-240	ENST00000570253	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	SLIT1	O75093	1534 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PKD1-240	ENST00000570253	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	LTK	P29376	864 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PKD1-240	ENST00000570253	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PKD1-240	ENST00000570253	IDI1	Q13907	227 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PKD1-240	ENST00000570253	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PKD1-240	ENST00000570253	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PKD1-240	ENST00000570253	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PKD1-240	ENST00000570253	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PKD1-240	ENST00000570253	NOS1	P29475	1434 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PKD1-240	ENST00000570253	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PKD1-240	ENST00000570253	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	KCNA6	P17658	529 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.53	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PKD1-240	ENST00000570253	TET3	O43151	1660 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PKD1-240	ENST00000570253	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.49	■■■□□ 2.79

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