RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 DCAF11Q8TEB1 546 aa32■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 PLA2R1Q13018 1463 aa32■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.99■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.97■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.96■■■□□ 2.71
EHD4-202ENST00000569223 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa31.94■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 NEFLP07196 543 aa31.94■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 MRS2Q9HD23 443 aa31.93■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.92■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 POLR3GLQ9BT43 218 aa31.89■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
EHD4-202ENST00000569223 BCANQ96GW7 911 aa31.88■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 ATP10AO60312 1499 aa31.88■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.88■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 A2MP01023 1474 aa31.87■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.85■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.85■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.84■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 FAM9BQ8IZU0 186 aa31.84■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.83■■■□□ 2.69
EHD4-202ENST00000569223 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.81■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 RGL3Q3MIN7 710 aa31.8■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 LAMC1P11047 1609 aa31.8■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 E9PCH4 1651 aa31.79■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 GPRASP1Q5JY77 1395 aa31.77■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
EHD4-202ENST00000569223 AFAP1Q8N556 730 aa31.76■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 FANCAO15360 1455 aa31.75■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 DEPDC5O75140 1603 aa31.74■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.74■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 ATP7AQ04656 1500 aa31.71■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 NBPF1Q3BBV0 1214 aa31.71■■■□□ 2.67
EHD4-202ENST00000569223 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.67■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 ASXL2Q76L83 1435 aa31.66■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 TRPM2O94759 1503 aa31.66■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.66■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 ADGRL1O94910 1474 aa31.64■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 TET3O43151 1660 aa31.64■■■□□ 2.66
EHD4-202ENST00000569223 CEP152O94986 1710 aa31.63■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.61■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.6■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 PTPRTO14522 1441 aa31.6■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 CLTCL1P53675 1640 aa31.58■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 MADDQ8WXG6 1647 aa31.58■■■□□ 2.65
EHD4-202ENST00000569223 TESK2Q96S53 571 aa31.54■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 KANK1Q14678 1352 aa31.54■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 RALBP1Q15311 655 aa31.54■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.53■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.52■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
EHD4-202ENST00000569223 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP31.51■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 TMC1Q8TDI8 760 aa31.5■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.5■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 IQGAP1P46940 1657 aa31.48■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 KIF3BO15066 747 aa31.48■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.48■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 OSCARQ8IYS5 282 aa31.46■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 ERICH6BQ5W0A0 696 aa31.46■■■□□ 2.63
EHD4-202ENST00000569223 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.45■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.42■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.42■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 TMF1P82094 1093 aa31.42■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 STAC3Q96MF2 364 aa31.42■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.41■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.41■■■□□ 2.62
EHD4-202ENST00000569223 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.38■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa31.36■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.35■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 NLRP13Q86W25 1043 aa31.34■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 NUDCQ9Y266 331 aa31.34■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 CD109Q6YHK3 1445 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 KIF1BO60333 1816 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.33■■■□□ 2.61
EHD4-202ENST00000569223 PANK3Q9H999 370 aa31.32■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.32■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 PPP4R2Q9NY27 417 aa31.31■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.28■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 IFT172Q9UG01 1749 aa31.28■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 MYOM2P54296 1465 aa31.27■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.27■■■□□ 2.6
EHD4-202ENST00000569223 MROH2AA6NES4 1674 aa31.26■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.26■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms