RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 KDM5DQ9BY66 1539 aa45.65■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.63■■■■■ 4.9
RAB40C-211ENST00000568586 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa45.6■■■■■ 4.89
RAB40C-211ENST00000568586 KIF15Q9NS87 1388 aa45.58■■■■■ 4.89
RAB40C-211ENST00000568586 STRCQ7RTU9 1775 aa45.55■■■■■ 4.88
RAB40C-211ENST00000568586 PZPP20742 1482 aa45.54■■■■■ 4.88
RAB40C-211ENST00000568586 ERBINQ96RT1 1412 aa45.52■■■■■ 4.88
RAB40C-211ENST00000568586 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.5■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 DMRT2Q9Y5R5 561 aa45.5■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 MROH1Q8NDA8 1641 aa45.49■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 MYO3AQ8NEV4 1616 aa45.48■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.46■■■■■ 4.87
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RAB40C-211ENST00000568586 ABCC3O15438 1527 aa45.46■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 NCOA1Q15788 1441 aa45.45■■■■■ 4.87
RAB40C-211ENST00000568586 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
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RAB40C-211ENST00000568586 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRL2O95490 1459 aa45.42■■■■■ 4.86
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RAB40C-211ENST00000568586 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
RAB40C-211ENST00000568586 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.4■■■■■ 4.86
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRTO14522 1441 aa45.39■■■■■ 4.86
RAB40C-211ENST00000568586 TNRQ92752 1358 aa45.39■■■■■ 4.86
RAB40C-211ENST00000568586 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa45.37■■■■■ 4.85
RAB40C-211ENST00000568586 A2ML1A8K2U0 1454 aa45.36■■■■■ 4.85
RAB40C-211ENST00000568586 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
RAB40C-211ENST00000568586 PLA2R1Q13018 1463 aa45.34■■■■■ 4.85
RAB40C-211ENST00000568586 DEPDC5O75140 1603 aa45.31■■■■■ 4.84
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa45.24■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 NLRP1Q9C000 1473 aa45.24■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP45.24■■■■■ 4.831e-6■■■□□ 17.3
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa45.24■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 PKD2Q13563 968 aa45.23■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 CEP152O94986 1710 aa45.22■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 FBXO41Q8TF61 875 aa45.21■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 ERVK-7P63135 1459 aa45.2■■■■■ 4.83
RAB40C-211ENST00000568586 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 VWDEQ8N2E2 1590 aa45.18■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa45.18■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 KANK1Q14678 1352 aa45.17■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 CERKQ8TCT0 537 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 ROCK1Q13464 1354 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 LMTK2Q8IWU2 1503 aa45.15■■■■■ 4.82
RAB40C-211ENST00000568586 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
RAB40C-211ENST00000568586 UGGT1Q9NYU2 1555 aa45.07■■■■■ 4.8
RAB40C-211ENST00000568586 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
RAB40C-211ENST00000568586 LTBP4Q8N2S1 1624 aa45■■■■■ 4.79
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
RAB40C-211ENST00000568586 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.95■■■■■ 4.79
RAB40C-211ENST00000568586 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
RAB40C-211ENST00000568586 EFCAB6Q5THR3 1501 aa44.93■■■■■ 4.78
RAB40C-211ENST00000568586 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.92■■■■■ 4.78
RAB40C-211ENST00000568586 MED14O60244 1454 aa44.89■■■■■ 4.78
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RAB40C-211ENST00000568586 NOS1P29475 1434 aa44.87■■■■■ 4.77
RAB40C-211ENST00000568586 ITGAEP38570 1179 aa44.87■■■■■ 4.77
RAB40C-211ENST00000568586 UBR1Q8IWV7 1749 aa44.86■■■■■ 4.77
RAB40C-211ENST00000568586 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
RAB40C-211ENST00000568586 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.81■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 TET3O43151 1660 aa44.79■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGAP23Q9P227 1491 aa44.78■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 SYNMO15061 1565 aa44.77■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 SLIT1O75093 1534 aa44.76■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 IDI1Q13907 227 aa44.76■■■■■ 4.76
RAB40C-211ENST00000568586 PIK3C2BO00750 1634 aa44.74■■■■■ 4.75
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RAB40C-211ENST00000568586 IQGAP3Q86VI3 1631 aa44.7■■■■■ 4.75
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RAB40C-211ENST00000568586 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP44.67■■■■■ 4.74
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RAB40C-211ENST00000568586 IQGAP1P46940 1657 aa44.65■■■■■ 4.74
RAB40C-211ENST00000568586 LTKP29376 864 aa44.65■■■■■ 4.74
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RAB40C-211ENST00000568586 HFM1A2PYH4 1435 aa44.5■■■■■ 4.71
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RAB40C-211ENST00000568586 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.35■■■■■ 4.69
RAB40C-211ENST00000568586 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.32■■■■■ 4.69
RAB40C-211ENST00000568586 MYO5BQ9ULV0 1848 aa44.29■■■■■ 4.68
RAB40C-211ENST00000568586 HDGFP51858 240 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.29■■■■■ 4.68
RAB40C-211ENST00000568586 RIMS2Q9UQ26 1411 aa44.28■■■■■ 4.68
RAB40C-211ENST00000568586 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa44.24■■■■■ 4.67
RAB40C-211ENST00000568586 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa44.24■■■■■ 4.67
RAB40C-211ENST00000568586 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP44.22■■■■■ 4.67
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