RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC5O15440 1437 aa26.52■■□□□ 1.84
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 DAPK1P53355 1430 aa26.5■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.49■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.49■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.46■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 STRCQ7RTU9 1775 aa26.46■■□□□ 1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRKQ15262 1439 aa26.45■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF15Q9NS87 1388 aa26.44■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.43■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERBINQ96RT1 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.41■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 PZPP20742 1482 aa26.39■■□□□ 1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.37■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRL2O95490 1459 aa26.36■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.36■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.35■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC3O15438 1527 aa26.34■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOA1Q15788 1441 aa26.34■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRTO14522 1441 aa26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.31■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNRQ92752 1358 aa26.3■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 DEPDC5O75140 1603 aa26.29■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.28■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.27■■□□□ 1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2R1Q13018 1463 aa26.26■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLRP1Q9C000 1473 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 KANK1Q14678 1352 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP152O94986 1710 aa26.24■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.22■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROCK1Q13464 1354 aa26.21■■□□□ 1.79
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.2■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVK-7P63135 1459 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.19■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKD2Q13563 968 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.18■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.785e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.14■■□□□ 1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.13■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.11■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.1■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.09■■□□□ 1.77
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC13BO14795 1591 aa26.07■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGAEP38570 1179 aa26.04■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.03■■□□□ 1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 TET3O43151 1660 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 ILDR2Q71H61 639 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBR1Q8IWV7 1749 aa26■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEURL4Q96JN8 1562 aa26■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED14O60244 1454 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 NOS1P29475 1434 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNMO15061 1565 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3C2BO00750 1634 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOCS7O14512 581 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLIT1O75093 1534 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUP155O75694 1391 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 IDI1Q13907 227 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQGAP1P46940 1657 aa25.89■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAIPQ13075 1403 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 EID1Q9Y6B2 187 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRB3O60242 1522 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 E9PCH4 1651 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 HFM1A2PYH4 1435 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPS1P31327 1500 aa25.83■■□□□ 1.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.82■■□□□ 1.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTKP29376 864 aa25.8■■□□□ 1.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.74■■□□□ 1.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.71■■□□□ 1.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFYVE9O95405 1425 aa25.7■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOM1O60784 492 aa25.69■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.67■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.8 ms