RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 SOCS7O14512 581 aa27.23■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 NCOA2Q15596 1464 aa27.23■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.22■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 KIF3BO15066 747 aa27.22■■□□□ 1.95
USP10-211ENST00000564566 TNRQ92752 1358 aa27.2■■□□□ 1.94
USP10-211ENST00000564566 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
USP10-211ENST00000564566 PZPP20742 1482 aa27.17■■□□□ 1.94
USP10-211ENST00000564566 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.16■■□□□ 1.94
USP10-211ENST00000564566 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.15■■□□□ 1.94
USP10-211ENST00000564566 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.14■■□□□ 1.93
USP10-211ENST00000564566 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.12■■□□□ 1.93
USP10-211ENST00000564566 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
USP10-211ENST00000564566 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.08■■□□□ 1.93
USP10-211ENST00000564566 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
USP10-211ENST00000564566 CPS1P31327 1500 aa27.07■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 TSPY4P0CV99 314 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 TSPY10P0CW01 314 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.06■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 PIP4K2BP78356 416 aa27.05■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 MIA2Q96PC5 1412 aa27.04■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 NLRP1Q9C000 1473 aa27.04■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.03■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.92
USP10-211ENST00000564566 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.01■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.01■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 DEPDC5O75140 1603 aa26.99■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.99■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 ABCC3O15438 1527 aa26.99■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 IQGAP1P46940 1657 aa26.98■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 HSPA1LP34931 641 aa26.98■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.98■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 TOM1O60784 492 aa26.97■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 CEP152O94986 1710 aa26.96■■□□□ 1.91
USP10-211ENST00000564566 MED14O60244 1454 aa26.94■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.93■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 ERVK-7P63135 1459 aa26.92■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.89■■□□□ 1.9
USP10-211ENST00000564566 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.87■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 ALKQ9UM73 1620 aa26.86■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.85■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.85■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 SYNMO15061 1565 aa26.84■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 MAP3K1Q13233 1512 aa26.83■■□□□ 1.89
USP10-211ENST00000564566 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.82■■□□□ 1.88
USP10-211ENST00000564566 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.81■■□□□ 1.88
USP10-211ENST00000564566 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
USP10-211ENST00000564566 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
USP10-211ENST00000564566 KIF15Q9NS87 1388 aa26.78■■□□□ 1.88
USP10-211ENST00000564566 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.75■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 ERBINQ96RT1 1412 aa26.73■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.73■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 ABCC5O15440 1437 aa26.72■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 PIK3C2BO00750 1634 aa26.72■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 SLIT1O75093 1534 aa26.71■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.7■■□□□ 1.87
USP10-211ENST00000564566 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.7■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.7■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 LTKP29376 864 aa26.69■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 DAPK1P53355 1430 aa26.67■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 APLP2Q06481 763 aa26.65■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.65■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 EID1Q9Y6B2 187 aa26.65■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 KANK1Q14678 1352 aa26.65■■□□□ 1.86
USP10-211ENST00000564566 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.61■■□□□ 1.85
USP10-211ENST00000564566 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.6■■□□□ 1.85
USP10-211ENST00000564566 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.6■■□□□ 1.85
USP10-211ENST00000564566 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.6■■□□□ 1.85
USP10-211ENST00000564566 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.58■■□□□ 1.84
USP10-211ENST00000564566 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
USP10-211ENST00000564566 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.56■■□□□ 1.84
USP10-211ENST00000564566 ADGRB3O60242 1522 aa26.52■■□□□ 1.84
USP10-211ENST00000564566 IDI1Q13907 227 aa26.52■■□□□ 1.84
USP10-211ENST00000564566 TMEM94Q12767 1356 aa26.51■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.49■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 TET3O43151 1660 aa26.47■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.47■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 NOS1P29475 1434 aa26.47■■□□□ 1.83
USP10-211ENST00000564566 KCNA6P17658 529 aa26.45■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 BCANQ96GW7 911 aa26.45■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.45■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 ADGRL2O95490 1459 aa26.43■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 NWD1Q149M9 1564 aa26.43■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.43■■□□□ 1.82
USP10-211ENST00000564566 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
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