RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562652.1

ITGAL-205, Transcript of integrin subunit alpha L, humanhuman

TSL 4

Gene ITGAL, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAL-205ENST00000562652 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.93■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.92■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.92■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 PZPP20742 1482 aa28.91■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 TSPY4P0CV99 314 aa28.89■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 TSPY10P0CW01 314 aa28.89■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 PKD2Q13563 968 aa28.89■■■□□ 2.22
ITGAL-205ENST00000562652 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 TNRQ92752 1358 aa28.87■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.86■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.85■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 MIA2Q96PC5 1412 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGAL-205ENST00000562652 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
ITGAL-205ENST00000562652 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.79■■■□□ 2.2
ITGAL-205ENST00000562652 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.78■■■□□ 2.2
ITGAL-205ENST00000562652 ABCC3O15438 1527 aa28.78■■■□□ 2.2
ITGAL-205ENST00000562652 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.76■■■□□ 2.2
ITGAL-205ENST00000562652 CEP152O94986 1710 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 NLRP1Q9C000 1473 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.73■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.73■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.72■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.71■■■□□ 2.19
ITGAL-205ENST00000562652 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.69■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 APLP2Q06481 763 aa28.67■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 DEPDC5O75140 1603 aa28.67■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 ERVK-7P63135 1459 aa28.66■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.66■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.64■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
ITGAL-205ENST00000562652 CPS1P31327 1500 aa28.64■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 KIF15Q9NS87 1388 aa28.63■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 ABCC5O15440 1437 aa28.62■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 IQGAP1P46940 1657 aa28.62■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.62■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 ERBINQ96RT1 1412 aa28.61■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 DAPK1P53355 1430 aa28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 MED14O60244 1454 aa28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.6■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.59■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.59■■■□□ 2.17
ITGAL-205ENST00000562652 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.54■■■□□ 2.16
ITGAL-205ENST00000562652 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.51■■■□□ 2.15
ITGAL-205ENST00000562652 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.47■■■□□ 2.15
ITGAL-205ENST00000562652 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.47■■■□□ 2.15
ITGAL-205ENST00000562652 ILDR2Q71H61 639 aa28.46■■■□□ 2.15
ITGAL-205ENST00000562652 SYNMO15061 1565 aa28.45■■■□□ 2.15
ITGAL-205ENST00000562652 PIK3C2BO00750 1634 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 KANK1Q14678 1352 aa28.45■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 SLIT1O75093 1534 aa28.43■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.42■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 TOM1O60784 492 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 PIP4K2BP78356 416 aa28.4■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 ADGRL2O95490 1459 aa28.4■■■□□ 2.14
ITGAL-205ENST00000562652 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
ITGAL-205ENST00000562652 ALKQ9UM73 1620 aa28.37■■■□□ 2.13
ITGAL-205ENST00000562652 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.37■■■□□ 2.13
ITGAL-205ENST00000562652 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.36■■■□□ 2.13
ITGAL-205ENST00000562652 HSPA1LP34931 641 aa28.33■■■□□ 2.13
ITGAL-205ENST00000562652 LTKP29376 864 aa28.32■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.32■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.29■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 SOCS7O14512 581 aa28.29■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.29■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 EID1Q9Y6B2 187 aa28.29■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 ADGRB3O60242 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 NOS1P29475 1434 aa28.26■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.26■■■□□ 2.12
ITGAL-205ENST00000562652 TET3O43151 1660 aa28.24■■■□□ 2.11
ITGAL-205ENST00000562652 IDI1Q13907 227 aa28.23■■■□□ 2.11
ITGAL-205ENST00000562652 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
ITGAL-205ENST00000562652 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.22■■■□□ 2.11
ITGAL-205ENST00000562652 UNC13BO14795 1591 aa28.21■■■□□ 2.11
ITGAL-205ENST00000562652 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.18■■■□□ 2.1
ITGAL-205ENST00000562652 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.14■■■□□ 2.1
ITGAL-205ENST00000562652 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
ITGAL-205ENST00000562652 E9PCH4 1651 aa28.11■■■□□ 2.09
ITGAL-205ENST00000562652 NWD1Q149M9 1564 aa28.11■■■□□ 2.09
ITGAL-205ENST00000562652 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGAL-205ENST00000562652 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.09■■■□□ 2.09
ITGAL-205ENST00000562652 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.08■■■□□ 2.09
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