RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 PKD2Q13563 968 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 TONSLQ96HA7 1378 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 A2MP01023 1474 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 DEPDC5O75140 1603 aa25.73■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCA6Q8N139 1617 aa25.7■■□□□ 1.71
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.7■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.67■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF3BO15066 747 aa25.65■■□□□ 1.7
USP3-AS1-208ENST00000560962 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.64■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.63■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 KANK1Q14678 1352 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-208ENST00000560962 TET3O43151 1660 aa25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP10AO60312 1499 aa25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLA2R1Q13018 1463 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-208ENST00000560962 E9PCH4 1651 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 REREQ9P2R6 1566 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 GGT6Q6P531 493 aa25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.46■■□□□ 1.67
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRTO14522 1441 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.44■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGLP35573 1532 aa25.44■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 CEP152O94986 1710 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ABCC3O15438 1527 aa25.41■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPM2O94759 1503 aa25.41■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.4■■□□□ 1.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.38■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPATQ14207 1427 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.32■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.31■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.31■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLTCL1P53675 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP3-AS1-208ENST00000560962 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOS1P29475 1434 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGL3Q3MIN7 710 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.21■■□□□ 1.63
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.17■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF1BO60333 1816 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 STAC3Q96MF2 364 aa25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 SYNMO15061 1565 aa25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 MLECQ14165 292 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 MIER1Q8N108 512 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3C2BO00750 1634 aa25.14■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRB3O60242 1522 aa25.13■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH2AA6NES4 1674 aa25.09■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 ERVK-7P63135 1459 aa25.09■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.08■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.08■■□□□ 1.61
USP3-AS1-208ENST00000560962 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 MADDQ8WXG6 1647 aa25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYOM2P54296 1465 aa25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 IFT172Q9UG01 1749 aa25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZMYM3Q14202 1370 aa25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 IDI1Q13907 227 aa25.03■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.03■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP47Q96K76 1375 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 LAMC1P11047 1609 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.98■■□□□ 1.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.97■■□□□ 1.59
USP3-AS1-208ENST00000560962 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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