RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560321.5

KNSTRN-210, Transcript of kinetochore localized astrin (SPAG5) binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene KNSTRN, Length 940 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRN-210ENST00000560321 PTPRKQ15262 1439 aa30.52■■■□□ 2.48
KNSTRN-210ENST00000560321 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
KNSTRN-210ENST00000560321 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
KNSTRN-210ENST00000560321 STRCQ7RTU9 1775 aa30.51■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.49■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 DAPK1P53355 1430 aa30.47■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCC5O15440 1437 aa30.47■■■□□ 2.47
KNSTRN-210ENST00000560321 PZPP20742 1482 aa30.44■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 KIF15Q9NS87 1388 aa30.44■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.43■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 ERBINQ96RT1 1412 aa30.42■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.42■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 PTPRTO14522 1441 aa30.4■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.4■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 NCOA1Q15788 1441 aa30.39■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 FBXO41Q8TF61 875 aa30.39■■■□□ 2.46
KNSTRN-210ENST00000560321 TNRQ92752 1358 aa30.39■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.37■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 PLA2R1Q13018 1463 aa30.35■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCC3O15438 1527 aa30.35■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 PKD2Q13563 968 aa30.34■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 KANK1Q14678 1352 aa30.33■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 CEP152O94986 1710 aa30.33■■■□□ 2.45
KNSTRN-210ENST00000560321 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.32■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 NLRP1Q9C000 1473 aa30.31■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 CERKQ8TCT0 537 aa30.3■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.29■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 ADGRL2O95490 1459 aa30.26■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 DEPDC5O75140 1603 aa30.26■■■□□ 2.44
KNSTRN-210ENST00000560321 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
KNSTRN-210ENST00000560321 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.431e-6■■□□□ 12.2
KNSTRN-210ENST00000560321 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.23■■■□□ 2.43
KNSTRN-210ENST00000560321 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.22■■■□□ 2.43
KNSTRN-210ENST00000560321 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
KNSTRN-210ENST00000560321 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.21■■■□□ 2.43
KNSTRN-210ENST00000560321 ERVK-7P63135 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
KNSTRN-210ENST00000560321 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.19■■■□□ 2.42
KNSTRN-210ENST00000560321 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.16■■■□□ 2.42
KNSTRN-210ENST00000560321 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.15■■■□□ 2.42
KNSTRN-210ENST00000560321 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.14■■■□□ 2.41
KNSTRN-210ENST00000560321 ROCK1Q13464 1354 aa30.11■■■□□ 2.41
KNSTRN-210ENST00000560321 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.11■■■□□ 2.41
KNSTRN-210ENST00000560321 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
KNSTRN-210ENST00000560321 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.07■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.07■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.06■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.05■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.04■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 ITGAEP38570 1179 aa30.03■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.02■■■□□ 2.4
KNSTRN-210ENST00000560321 NEURL4Q96JN8 1562 aa30■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 MED14O60244 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 TET3O43151 1660 aa29.98■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 IQGAP1P46940 1657 aa29.98■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.98■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 EID1Q9Y6B2 187 aa29.97■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 UNC13BO14795 1591 aa29.97■■■□□ 2.39
KNSTRN-210ENST00000560321 PIK3C2BO00750 1634 aa29.95■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.94■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 CPS1P31327 1500 aa29.92■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 SLIT1O75093 1534 aa29.91■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 NOS1P29475 1434 aa29.89■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.89■■■□□ 2.38
KNSTRN-210ENST00000560321 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.87■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 IDI1Q13907 227 aa29.87■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.87■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 SYNMO15061 1565 aa29.86■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 NUP155O75694 1391 aa29.84■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.84■■■□□ 2.37
KNSTRN-210ENST00000560321 ADGRB3O60242 1522 aa29.82■■■□□ 2.36
KNSTRN-210ENST00000560321 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
KNSTRN-210ENST00000560321 E9PCH4 1651 aa29.8■■■□□ 2.36
KNSTRN-210ENST00000560321 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.79■■■□□ 2.36
KNSTRN-210ENST00000560321 LTKP29376 864 aa29.76■■■□□ 2.35
KNSTRN-210ENST00000560321 TOM1O60784 492 aa29.74■■■□□ 2.35
KNSTRN-210ENST00000560321 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.73■■■□□ 2.35
KNSTRN-210ENST00000560321 BCANQ96GW7 911 aa29.7■■■□□ 2.35
KNSTRN-210ENST00000560321 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.67■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.67■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 NAIPQ13075 1403 aa29.67■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.66■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.65■■■□□ 2.34
KNSTRN-210ENST00000560321 HFM1A2PYH4 1435 aa29.64■■■□□ 2.34
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