RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557400.5

NEDD1-210, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 604 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-210ENST00000557400 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.25■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 TNRQ92752 1358 aa27.24■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 PZPP20742 1482 aa27.23■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.22■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 TSPY4P0CV99 314 aa27.22■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 TSPY10P0CW01 314 aa27.22■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.21■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.21■■□□□ 1.95
NEDD1-210ENST00000557400 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.19■■□□□ 1.94
NEDD1-210ENST00000557400 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.18■■□□□ 1.94
NEDD1-210ENST00000557400 ILDR2Q71H61 639 aa27.17■■□□□ 1.94
NEDD1-210ENST00000557400 MIA2Q96PC5 1412 aa27.14■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.13■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 NLRP1Q9C000 1473 aa27.12■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.11■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.09■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 MAP3K1Q13233 1512 aa27.08■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.08■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.08■■□□□ 1.93
NEDD1-210ENST00000557400 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 SOCS7O14512 581 aa27.05■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.05■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 ABCC3O15438 1527 aa27.05■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.05■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.04■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 CPS1P31327 1500 aa27.04■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
NEDD1-210ENST00000557400 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 MED14O60244 1454 aa27■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 ERVK-7P63135 1459 aa26.98■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 DEPDC5O75140 1603 aa26.97■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 TOM1O60784 492 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.96■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.95■■□□□ 1.91
NEDD1-210ENST00000557400 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.95■■□□□ 1.9
NEDD1-210ENST00000557400 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
NEDD1-210ENST00000557400 PIP4K2BP78356 416 aa26.93■■□□□ 1.9
NEDD1-210ENST00000557400 KIF15Q9NS87 1388 aa26.92■■□□□ 1.9
NEDD1-210ENST00000557400 HSPA1LP34931 641 aa26.89■■□□□ 1.9
NEDD1-210ENST00000557400 ABCC5O15440 1437 aa26.88■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 IQGAP1P46940 1657 aa26.87■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 ERBINQ96RT1 1412 aa26.87■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 APLP2Q06481 763 aa26.86■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.85■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 CEP152O94986 1710 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD1-210ENST00000557400 DAPK1P53355 1430 aa26.82■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.81■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.8■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.79■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.79■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.79■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.78■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 ALKQ9UM73 1620 aa26.78■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 SLIT1O75093 1534 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 KANK1Q14678 1352 aa26.77■■□□□ 1.88
NEDD1-210ENST00000557400 LTKP29376 864 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.76■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 SYNMO15061 1565 aa26.75■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.74■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 EID1Q9Y6B2 187 aa26.73■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.71■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.71■■□□□ 1.87
NEDD1-210ENST00000557400 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.7■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.68■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 PIK3C2BO00750 1634 aa26.65■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 IDI1Q13907 227 aa26.64■■□□□ 1.86
NEDD1-210ENST00000557400 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.63■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 ADGRL2O95490 1459 aa26.61■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 NOS1P29475 1434 aa26.6■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NEDD1-210ENST00000557400 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 ADGRB3O60242 1522 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 KCNA6P17658 529 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 TMEM94Q12767 1356 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD1-210ENST00000557400 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD1-210ENST00000557400 TET3O43151 1660 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD1-210ENST00000557400 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD1-210ENST00000557400 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NEDD1-210ENST00000557400 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NEDD1-210ENST00000557400 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NEDD1-210ENST00000557400 BCANQ96GW7 911 aa26.44■■□□□ 1.82
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