RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, human

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIPC-208	ENST00000557115	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CIPC-208	ENST00000557115	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.9	■■■■□ 3.02
CIPC-208	ENST00000557115	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.88	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.88	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	TNR	Q92752	1358 aa		33.85	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	PZP	P20742	1482 aa		33.83	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	PKD2	Q13563	968 aa		33.83	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
CIPC-208	ENST00000557115	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.81	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.8	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.8	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.79	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.79	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	ABCC5	O15440	1437 aa		33.79	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.76	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.76	■■■■□ 3
CIPC-208	ENST00000557115	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	DAPK1	P53355	1430 aa		33.73	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.73	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	ABCC3	O15438	1527 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.7	■■■□□ 2.99
CIPC-208	ENST00000557115	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.67	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.66	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.65	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.65	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CIPC-208	ENST00000557115	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.62	■■■□□ 2.97
CIPC-208	ENST00000557115	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.61	■■■□□ 2.97
CIPC-208	ENST00000557115	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CIPC-208	ENST00000557115	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CIPC-208	ENST00000557115	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.57	■■■□□ 2.97
CIPC-208	ENST00000557115	KANK1	Q14678	1352 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CIPC-208	ENST00000557115	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CIPC-208	ENST00000557115	CEP152	O94986	1710 aa		33.54	■■■□□ 2.96
CIPC-208	ENST00000557115	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CIPC-208	ENST00000557115	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CIPC-208	ENST00000557115	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
CIPC-208	ENST00000557115	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CIPC-208	ENST00000557115	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.46	■■■□□ 2.95
CIPC-208	ENST00000557115	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CIPC-208	ENST00000557115	MED14	O60244	1454 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CIPC-208	ENST00000557115	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.38	■■■□□ 2.93
CIPC-208	ENST00000557115	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIPC-208	ENST00000557115	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CIPC-208	ENST00000557115	CPS1	P31327	1500 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CIPC-208	ENST00000557115	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	ITGAE	P38570	1179 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	LTK	P29376	864 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	IDI1	Q13907	227 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CIPC-208	ENST00000557115	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	TOM1	O60784	492 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	SLIT1	O75093	1534 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.21	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CIPC-208	ENST00000557115	NOS1	P29475	1434 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIPC-208	ENST00000557115	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIPC-208	ENST00000557115	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CIPC-208	ENST00000557115	SYNM	O15061	1565 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CIPC-208	ENST00000557115	TET3	O43151	1660 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CIPC-208	ENST00000557115	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
CIPC-208	ENST00000557115	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIPC-208	ENST00000557115	UNC13B	O14795	1591 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIPC-208	ENST00000557115	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	NUP155	O75694	1391 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	HSPA1L	P34931	641 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CIPC-208	ENST00000557115	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
CIPC-208	ENST00000557115	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CIPC-208	ENST00000557115	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
CIPC-208	ENST00000557115	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
CIPC-208	ENST00000557115	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CIPC-208	ENST00000557115	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.94	■■■□□ 2.86

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