RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATP7AQ04656 1500 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 GGT6Q6P531 493 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 IQGAP1P46940 1657 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 A2MP01023 1474 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 EEA1Q15075 1411 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 DEPDC5O75140 1603 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRC7Q96NW7 1537 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 UBTFP17480 764 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 ANKLE2Q86XL3 938 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 SYNMO15061 1565 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 POTEAQ6S8J7 498 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 TNRQ92752 1358 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC18Q5T9S5 1454 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GTF3AP2-201ENST00000557014 MED14O60244 1454 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 KDM5DQ9BY66 1539 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 PZPP20742 1482 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM135AQ9P2D6 1515 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 MIA2Q96PC5 1412 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 NLRP1Q9C000 1473 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIF3BO15066 747 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 PHLPP1O60346 1717 aa4.69□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCNB3Q8WWL7 1395 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 TIAM1Q13009 1591 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 CEP152O94986 1710 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 FYCO1Q9BQS8 1478 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM135BQ49AJ0 1406 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 MBD5Q9P267 1494 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 ABCC3O15438 1527 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERVK-7P63135 1459 aa4.65□□□□□ -1.66
GTF3AP2-201ENST00000557014 LTKP29376 864 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TXNDC2Q86VQ3 553 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRIM52Q96A61 297 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM94Q12767 1356 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 PIK3C2BO00750 1634 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 NCOA2Q15596 1464 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC141Q6ZP82 1450 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLIT1O75093 1534 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAP3K1Q13233 1512 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRP6O75581 1613 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MROH1Q8NDA8 1641 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MTUS2Q5JR59 1369 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 EID1Q9Y6B2 187 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 SHPRHQ149N8 1683 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 JCADQ9P266 1359 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 POTEHQ6S545 545 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLAIN2Q9P270 581 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 NWD1Q149M9 1564 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TET3O43151 1660 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 KCNA6P17658 529 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 KCNA4P22459 653 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 RXRBP28702 533 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 MSH6P52701 1360 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3AP2-201ENST00000557014 TSPY4P0CV99 314 aa4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms