RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556975.5

TMEM260-214, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM260, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-214ENST00000556975 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.33■■■■□ 3.25
TMEM260-214ENST00000556975 CERKQ8TCT0 537 aa35.32■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.32■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.31■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 NCOA1Q15788 1441 aa35.27■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.27■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 PTPRTO14522 1441 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 DAPK1P53355 1430 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-214ENST00000556975 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.26■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 PZPP20742 1482 aa35.25■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.22■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 KIF15Q9NS87 1388 aa35.21■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
TMEM260-214ENST00000556975 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.17■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 TNRQ92752 1358 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 PLA2R1Q13018 1463 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 ERBINQ96RT1 1412 aa35.15■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.15■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 ABCC3O15438 1527 aa35.15■■■■□ 3.22
TMEM260-214ENST00000556975 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.12■■■■□ 3.21
TMEM260-214ENST00000556975 PKD2Q13563 968 aa35.11■■■■□ 3.21
TMEM260-214ENST00000556975 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.08■■■■□ 3.21
TMEM260-214ENST00000556975 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.08■■■■□ 3.21
TMEM260-214ENST00000556975 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
TMEM260-214ENST00000556975 NLRP1Q9C000 1473 aa35.04■■■■□ 3.2
TMEM260-214ENST00000556975 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
TMEM260-214ENST00000556975 ADGRL2O95490 1459 aa35.03■■■■□ 3.2
TMEM260-214ENST00000556975 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.02■■■■□ 3.2
TMEM260-214ENST00000556975 CEP152O94986 1710 aa35.01■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 DEPDC5O75140 1603 aa35■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.98■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 ERVK-7P63135 1459 aa34.97■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 LTBP4Q8N2S1 1624 aa34.95■■■■□ 3.19
TMEM260-214ENST00000556975 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.94■■■■□ 3.18
TMEM260-214ENST00000556975 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM260-214ENST00000556975 KANK1Q14678 1352 aa34.93■■■■□ 3.18
TMEM260-214ENST00000556975 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
TMEM260-214ENST00000556975 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.89■■■■□ 3.18
TMEM260-214ENST00000556975 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.88■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.88■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.86■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.83■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.83■■■■□ 3.17
TMEM260-214ENST00000556975 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
TMEM260-214ENST00000556975 ROCK1Q13464 1354 aa34.8■■■■□ 3.16
TMEM260-214ENST00000556975 MED14O60244 1454 aa34.78■■■■□ 3.16
TMEM260-214ENST00000556975 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.75■■■■□ 3.15
TMEM260-214ENST00000556975 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-214ENST00000556975 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
TMEM260-214ENST00000556975 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.69■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 NOS1P29475 1434 aa34.68■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.66■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 SLIT1O75093 1534 aa34.65■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 IDI1Q13907 227 aa34.65■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 PIK3C2BO00750 1634 aa34.64■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 ITGAEP38570 1179 aa34.64■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 UNC13BO14795 1591 aa34.64■■■■□ 3.14
TMEM260-214ENST00000556975 IQGAP1P46940 1657 aa34.63■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 SYNMO15061 1565 aa34.62■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 TET3O43151 1660 aa34.6■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 LTKP29376 864 aa34.6■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.6■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 CPS1P31327 1500 aa34.6■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.59■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.58■■■■□ 3.13
TMEM260-214ENST00000556975 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.57■■■■□ 3.12
TMEM260-214ENST00000556975 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.56■■■■□ 3.12
TMEM260-214ENST00000556975 EID1Q9Y6B2 187 aa34.55■■■■□ 3.12
TMEM260-214ENST00000556975 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.54■■■■□ 3.12
TMEM260-214ENST00000556975 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.51■■■■□ 3.11
TMEM260-214ENST00000556975 ILDR2Q71H61 639 aa34.49■■■■□ 3.11
TMEM260-214ENST00000556975 NUP155O75694 1391 aa34.49■■■■□ 3.11
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TMEM260-214ENST00000556975 E9PCH4 1651 aa34.44■■■■□ 3.1
TMEM260-214ENST00000556975 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.41■■■■□ 3.1
TMEM260-214ENST00000556975 NAIPQ13075 1403 aa34.37■■■■□ 3.09
TMEM260-214ENST00000556975 TOM1O60784 492 aa34.36■■■■□ 3.09
TMEM260-214ENST00000556975 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.35■■■■□ 3.09
TMEM260-214ENST00000556975 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.35■■■■□ 3.09
TMEM260-214ENST00000556975 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
TMEM260-214ENST00000556975 ZFYVE9O95405 1425 aa34.32■■■■□ 3.08
TMEM260-214ENST00000556975 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
TMEM260-214ENST00000556975 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.31■■■■□ 3.08
TMEM260-214ENST00000556975 SOCS7O14512 581 aa34.28■■■■□ 3.08
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