RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-211ENST00000555834 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 MLECQ14165 292 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.48■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 HMMRO75330 724 aa20.46■□□□□ 0.87
RPS6KL1-211ENST00000555834 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.44■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 NPHP1O15259 732 aa20.43■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 STK31Q9BXU1 1019 aa20.41■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.41■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.4■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.39■□□□□ 0.86
RPS6KL1-211ENST00000555834 GPATCH3Q96I76 525 aa20.39■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF16BQ96L93 1317 aa20.38■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 PANK3Q9H999 370 aa20.37■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 COG6Q9Y2V7 657 aa20.37■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.37■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 CLSTN1O94985 981 aa20.36■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.36■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.36■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 E9PSI1 815 aa20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 NFKBIBQ15653 356 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.34■□□□□ 0.85
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.33■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF3BO15066 747 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.32■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.31■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.3■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.29■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 RILPL2Q969X0 211 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 SMARCA4P51532 1647 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 USP47Q96K76 1375 aa20.28■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 TPM3P06753 285 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 GORABQ5T7V8 394 aa20.27■□□□□ 0.84
RPS6KL1-211ENST00000555834 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.26■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF592Q92610 1267 aa20.26■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.25■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 H3BQV1 296 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 IFFO2Q5TF58 517 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 BECN2A8MW95 431 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF3AQ9Y496 699 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 APAF1O14727 1248 aa20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.21■□□□□ 0.83
RPS6KL1-211ENST00000555834 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.2■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.19■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 REC8O95072 547 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 IL27Q8NEV9 243 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 MRE11P49959 708 aa20.18■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 MCTP1Q6DN14 999 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 GPS2Q13227 327 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.17■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 JPH4Q96JJ6 628 aa20.16■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC7Q96M83 1385 aa20.15■□□□□ 0.82
RPS6KL1-211ENST00000555834 NUCB2P80303 420 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.14■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 PDE4CQ08493 712 aa20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.12■□□□□ 0.81
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