RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.71■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.69■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.69■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.68■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TNRQ92752 1358 aa30.66■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.65■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PZPP20742 1482 aa30.64■■■□□ 2.5
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP3K1Q13233 1512 aa30.63■■■□□ 2.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MIA2Q96PC5 1412 aa30.57■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.55■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.54■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.54■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.54■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.53■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NLRP1Q9C000 1473 aa30.51■■■□□ 2.48
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APLP2Q06481 763 aa30.46■■■□□ 2.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC3O15438 1527 aa30.44■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.44■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.43■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ILDR2Q71H61 639 aa30.41■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.4■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.39■■■□□ 2.46
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED14O60244 1454 aa30.38■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CPS1P31327 1500 aa30.37■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.37■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF15Q9NS87 1388 aa30.35■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCC5O15440 1437 aa30.35■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERVK-7P63135 1459 aa30.35■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.34■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TOM1O60784 492 aa30.34■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.34■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DEPDC5O75140 1603 aa30.33■■■□□ 2.45
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERBINQ96RT1 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.28■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOCS7O14512 581 aa30.28■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.28■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.27■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.44
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIP4K2BP78356 416 aa30.26■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAPK1P53355 1430 aa30.25■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.25■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.25■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEP152O94986 1710 aa30.25■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IQGAP1P46940 1657 aa30.22■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.21■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KANK1Q14678 1352 aa30.21■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSPA1LP34931 641 aa30.21■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.2■■■□□ 2.43
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.19■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.19■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.17■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LTKP29376 864 aa30.16■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EID1Q9Y6B2 187 aa30.15■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.14■■■□□ 2.42
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLIT1O75093 1534 aa30.12■■■□□ 2.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.12■■■□□ 2.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.11■■■□□ 2.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.08■■■□□ 2.41
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.07■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IDI1Q13907 227 aa30.07■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.06■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALKQ9UM73 1620 aa30.04■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRL2O95490 1459 aa30.03■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIK3C2BO00750 1634 aa30.03■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYNMO15061 1565 aa30.03■■■□□ 2.4
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.99■■■□□ 2.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NOS1P29475 1434 aa29.98■■■□□ 2.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.98■■■□□ 2.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.96■■■□□ 2.39
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNA6P17658 529 aa29.91■■■□□ 2.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.89■■■□□ 2.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TET3O43151 1660 aa29.86■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADGRB3O60242 1522 aa29.86■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM94Q12767 1356 aa29.84■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BCANQ96GW7 911 aa29.83■■■□□ 2.37
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.79■■■□□ 2.36
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