RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.1■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.09■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.09■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.09■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 DEPDC5O75140 1603 aa27.08■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 REREQ9P2R6 1566 aa27.06■■□□□ 1.92
LRP1-204ENST00000553277 NUP155O75694 1391 aa27.06■■□□□ 1.92
LRP1-204ENST00000553277 ATP10AO60312 1499 aa27.04■■□□□ 1.92
LRP1-204ENST00000553277 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.02■■□□□ 1.92
LRP1-204ENST00000553277 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 VWDEQ8N2E2 1590 aa27■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.99■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 KIF3BO15066 747 aa26.98■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 AGLP35573 1532 aa26.97■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LRP1-204ENST00000553277 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.93■■□□□ 1.9
LRP1-204ENST00000553277 PKD2Q13563 968 aa26.91■■□□□ 1.9
LRP1-204ENST00000553277 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.89■■□□□ 1.9
LRP1-204ENST00000553277 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.92e-8■□□□□ 9
LRP1-204ENST00000553277 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.89■■□□□ 1.9
LRP1-204ENST00000553277 KANK1Q14678 1352 aa26.89■■□□□ 1.9
LRP1-204ENST00000553277 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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LRP1-204ENST00000553277 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.84■■□□□ 1.89
LRP1-204ENST00000553277 FOXD1Q16676 465 aa26.83■■□□□ 1.89
LRP1-204ENST00000553277 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.83■■□□□ 1.89
LRP1-204ENST00000553277 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.81■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 GGT6Q6P531 493 aa26.79■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 ABCC3O15438 1527 aa26.79■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 E9PCH4 1651 aa26.78■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 NEUROD1Q13562 356 aa26.78■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.77■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 PLA2R1Q13018 1463 aa26.77■■□□□ 1.88
LRP1-204ENST00000553277 MIER1Q8N108 512 aa26.76■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 PTPRTO14522 1441 aa26.75■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 CEP152O94986 1710 aa26.74■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.74■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.73■■□□□ 1.87
LRP1-204ENST00000553277 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.68■■□□□ 1.86
LRP1-204ENST00000553277 NPATQ14207 1427 aa26.68■■□□□ 1.86
LRP1-204ENST00000553277 TRPM2O94759 1503 aa26.67■■□□□ 1.86
LRP1-204ENST00000553277 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.66■■□□□ 1.86
LRP1-204ENST00000553277 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.63■■□□□ 1.85
LRP1-204ENST00000553277 TONSLQ96HA7 1378 aa26.62■■□□□ 1.85
LRP1-204ENST00000553277 NOS1P29475 1434 aa26.6■■□□□ 1.85
LRP1-204ENST00000553277 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.59■■□□□ 1.85
LRP1-204ENST00000553277 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LRP1-204ENST00000553277 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.55■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 MLECQ14165 292 aa26.54■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.54■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 CLTCL1P53675 1640 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 MROH2AA6NES4 1674 aa26.52■■□□□ 1.84
LRP1-204ENST00000553277 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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LRP1-204ENST00000553277 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.5■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 PIK3C2BO00750 1634 aa26.49■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 SYNMO15061 1565 aa26.48■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 ERVK-7P63135 1459 aa26.48■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.47■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.46■■□□□ 1.83
LRP1-204ENST00000553277 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.45■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.44■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.41■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 KIF1BO60333 1816 aa26.41■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 STAC3Q96MF2 364 aa26.41■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.41■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.4■■□□□ 1.82
LRP1-204ENST00000553277 ADGRB3O60242 1522 aa26.39■■□□□ 1.81
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LRP1-204ENST00000553277 RGL3Q3MIN7 710 aa26.34■■□□□ 1.81
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LRP1-204ENST00000553277 MADDQ8WXG6 1647 aa26.32■■□□□ 1.8
LRP1-204ENST00000553277 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
LRP1-204ENST00000553277 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.3■■□□□ 1.8
LRP1-204ENST00000553277 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.3■■□□□ 1.8
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LRP1-204ENST00000553277 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.28■■□□□ 1.8
LRP1-204ENST00000553277 IFT172Q9UG01 1749 aa26.27■■□□□ 1.8
LRP1-204ENST00000553277 MYOM2P54296 1465 aa26.26■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 NLRP1Q9C000 1473 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.23■■□□□ 1.79
LRP1-204ENST00000553277 PPLO60437 1756 aa26.22■■□□□ 1.79
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