RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.67■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 TNRQ92752 1358 aa22.65■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CS-230ENST00000551968 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.61■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.6■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 MED14O60244 1454 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 PZPP20742 1482 aa22.59■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 DEPDC5O75140 1603 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-230ENST00000551968 IQGAP1P46940 1657 aa22.57■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 MBD5Q9P267 1494 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.55■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 MIA2Q96PC5 1412 aa22.52■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 KIF3BO15066 747 aa22.52■■□□□ 1.2
CS-230ENST00000551968 TIAM1Q13009 1591 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 SYNMO15061 1565 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 NLRP1Q9C000 1473 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 POTEAQ6S8J7 498 aa22.48■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.46■■□□□ 1.19
CS-230ENST00000551968 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-230ENST00000551968 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.41■■□□□ 1.18
CS-230ENST00000551968 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.37■■□□□ 1.17
CS-230ENST00000551968 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-230ENST00000551968 ABCC3O15438 1527 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-230ENST00000551968 ERVK-7P63135 1459 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-230ENST00000551968 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.33■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 NCOA2Q15596 1464 aa22.33■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 LTKP29376 864 aa22.32■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.31■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 CEP162Q5TB80 1403 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 CEP152O94986 1710 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.28■■□□□ 1.16
CS-230ENST00000551968 SLIT1O75093 1534 aa22.26■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.24■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 MAP3K1Q13233 1512 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.23■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 TMEM94Q12767 1356 aa22.22■■□□□ 1.15
CS-230ENST00000551968 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 PIK3C2BO00750 1634 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 PHLPP1O60346 1717 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 TSPY4P0CV99 314 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 TSPY10P0CW01 314 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-230ENST00000551968 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 TET3O43151 1660 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 LRP6O75581 1613 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 KCNA6P17658 529 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 EID1Q9Y6B2 187 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CS-230ENST00000551968 JCADQ9P266 1359 aa22.08■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 NWD1Q149M9 1564 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 TRIM52Q96A61 297 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 SLAIN2Q9P270 581 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-230ENST00000551968 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.01■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 IDI1Q13907 227 aa22■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 MSH6P52701 1360 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.98■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-230ENST00000551968 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.116e-9■□□□□ 10
CS-230ENST00000551968 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 KIF15Q9NS87 1388 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 ADGRB3O60242 1522 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 SHPRHQ149N8 1683 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.91■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 ERBINQ96RT1 1412 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-230ENST00000551968 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.9■■□□□ 1.1
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