RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551418.5

PRPF40B-215, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-215ENST00000551418 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.51■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.5■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.49■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 TNRQ92752 1358 aa28.47■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.46■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.46■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.46■■■□□ 2.15
PRPF40B-215ENST00000551418 TSPY4P0CV99 314 aa28.45■■■□□ 2.14
PRPF40B-215ENST00000551418 TSPY10P0CW01 314 aa28.45■■■□□ 2.14
PRPF40B-215ENST00000551418 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.44■■■□□ 2.14
PRPF40B-215ENST00000551418 PZPP20742 1482 aa28.44■■■□□ 2.14
PRPF40B-215ENST00000551418 ILDR2Q71H61 639 aa28.43■■■□□ 2.14
PRPF40B-215ENST00000551418 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.38■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.37■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 MIA2Q96PC5 1412 aa28.36■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.36■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.35■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 MAP3K1Q13233 1512 aa28.33■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.33■■■□□ 2.13
PRPF40B-215ENST00000551418 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 ABCC3O15438 1527 aa28.3■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.29■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.28■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 NLRP1Q9C000 1473 aa28.27■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.27■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.27■■■□□ 2.12
PRPF40B-215ENST00000551418 CEP152O94986 1710 aa28.24■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.24■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.21■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 ERVK-7P63135 1459 aa28.21■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 ABCC5O15440 1437 aa28.2■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
PRPF40B-215ENST00000551418 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.19■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.19■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 MED14O60244 1454 aa28.19■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 DEPDC5O75140 1603 aa28.18■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 PIP4K2BP78356 416 aa28.17■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 CPS1P31327 1500 aa28.17■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 KIF15Q9NS87 1388 aa28.16■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.16■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.15■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 SOCS7O14512 581 aa28.14■■■□□ 2.1
PRPF40B-215ENST00000551418 IQGAP1P46940 1657 aa28.13■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 HSPA1LP34931 641 aa28.13■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.13■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.11■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 APLP2Q06481 763 aa28.1■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 DAPK1P53355 1430 aa28.09■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 TOM1O60784 492 aa28.09■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.09■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 ALKQ9UM73 1620 aa28.08■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.08■■■□□ 2.09
PRPF40B-215ENST00000551418 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
PRPF40B-215ENST00000551418 LTKP29376 864 aa28.07■■■□□ 2.08
PRPF40B-215ENST00000551418 ERBINQ96RT1 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
PRPF40B-215ENST00000551418 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.04■■■□□ 2.08
PRPF40B-215ENST00000551418 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.02■■■□□ 2.08
PRPF40B-215ENST00000551418 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.01■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.99■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 PIK3C2BO00750 1634 aa27.98■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 SLIT1O75093 1534 aa27.97■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.96■■■□□ 2.07
PRPF40B-215ENST00000551418 IDI1Q13907 227 aa27.94■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 KANK1Q14678 1352 aa27.94■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.9■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.9■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 SYNMO15061 1565 aa27.9■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 EID1Q9Y6B2 187 aa27.89■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PRPF40B-215ENST00000551418 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.88■■■□□ 2.05
PRPF40B-215ENST00000551418 ADGRL2O95490 1459 aa27.85■■■□□ 2.05
PRPF40B-215ENST00000551418 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.84■■■□□ 2.05
PRPF40B-215ENST00000551418 NOS1P29475 1434 aa27.84■■■□□ 2.05
PRPF40B-215ENST00000551418 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.81■■■□□ 2.04
PRPF40B-215ENST00000551418 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
PRPF40B-215ENST00000551418 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.78■■■□□ 2.04
PRPF40B-215ENST00000551418 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PRPF40B-215ENST00000551418 TET3O43151 1660 aa27.78■■■□□ 2.04
PRPF40B-215ENST00000551418 ADGRB3O60242 1522 aa27.75■■■□□ 2.03
PRPF40B-215ENST00000551418 KCNA6P17658 529 aa27.73■■■□□ 2.03
PRPF40B-215ENST00000551418 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.73■■■□□ 2.03
PRPF40B-215ENST00000551418 TMEM94Q12767 1356 aa27.73■■■□□ 2.03
PRPF40B-215ENST00000551418 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.72■■■□□ 2.03
PRPF40B-215ENST00000551418 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PRPF40B-215ENST00000551418 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
PRPF40B-215ENST00000551418 BCANQ96GW7 911 aa27.67■■■□□ 2.02
PRPF40B-215ENST00000551418 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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