RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 A2MP01023 1474 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 BCORL1Q5H9F3 1711 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-220ENST00000550700 ABCA6Q8N139 1617 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-220ENST00000550700 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-220ENST00000550700 AGLP35573 1532 aa13.8□□□□□ -0.2
CS-220ENST00000550700 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-220ENST00000550700 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.78□□□□□ -0.2
CS-220ENST00000550700 UNC13BO14795 1591 aa13.77□□□□□ -0.21
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CS-220ENST00000550700 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 KIF3BO15066 747 aa13.75□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 TRIM52Q96A61 297 aa13.74□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 NUP155O75694 1391 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.72□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 CLSPNQ9HAW4 1339 aa13.71□□□□□ -0.21
CS-220ENST00000550700 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.69□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 TET3O43151 1660 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.68□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 GGT6Q6P531 493 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 MPHOSPH9Q99550 1183 aa13.67□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.226e-9■□□□□ 10
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CS-220ENST00000550700 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.66□□□□□ -0.22
CS-220ENST00000550700 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
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CS-220ENST00000550700 PZPP20742 1482 aa13.65□□□□□ -0.22
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CS-220ENST00000550700 ABCC3O15438 1527 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 MROH2AA6NES4 1674 aa13.63□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 CEP152O94986 1710 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.62□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 PKD2Q13563 968 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.6□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 E9PCH4 1651 aa13.59□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
CS-220ENST00000550700 MLECQ14165 292 aa13.57□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 ADAMTSL3P82987 1691 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.56□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 PTPRTO14522 1441 aa13.55□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 POTEHQ6S545 545 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 ZMYM3Q14202 1370 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 NPATQ14207 1427 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 TRPM2O94759 1503 aa13.54□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 CCDC144AA2RUR9 1427 aa13.53□□□□□ -0.24
CS-220ENST00000550700 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.53□□□□□ -0.24
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CS-220ENST00000550700 MADDQ8WXG6 1647 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 NOS1P29475 1434 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 C3P01024 1663 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 KIF1BO60333 1816 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 ERVK-7P63135 1459 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 STAC3Q96MF2 364 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 PIK3C2BO00750 1634 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 PLA2R1Q13018 1463 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-220ENST00000550700 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.46□□□□□ -0.25
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CS-220ENST00000550700 TNRQ92752 1358 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-220ENST00000550700 TONSLQ96HA7 1378 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-220ENST00000550700 CLTCL1P53675 1640 aa13.44□□□□□ -0.26
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CS-220ENST00000550700 PTPRMP28827 1452 aa13.43□□□□□ -0.26
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CS-220ENST00000550700 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.42□□□□□ -0.26
CS-220ENST00000550700 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
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CS-220ENST00000550700 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.4□□□□□ -0.26
CS-220ENST00000550700 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 ADGRB3O60242 1522 aa13.39□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 MYO3AQ8NEV4 1616 aa13.38□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.37□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CS-220ENST00000550700 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.37□□□□□ -0.27
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