RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PLCH2O75038 1416 aa15.53■□□□□ 0.08
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CS-217ENST00000550044 CREBZFQ9NS37 354 aa15.51■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 OTUD5Q96G74 571 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 NCOA1Q15788 1441 aa15.49■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.48■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 KDM5CP41229 1560 aa15.48■□□□□ 0.07
CS-217ENST00000550044 ABCA6Q8N139 1617 aa15.47■□□□□ 0.07
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CS-217ENST00000550044 AFAP1Q8N556 730 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.44■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.44■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 SLC24A1O60721 1099 aa15.43■□□□□ 0.06
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CS-217ENST00000550044 POTEMA6NI47 508 aa15.41■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CS-217ENST00000550044 AGLP35573 1532 aa15.4■□□□□ 0.06
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CS-217ENST00000550044 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.36■□□□□ 0.05
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CS-217ENST00000550044 ABCC1P33527 1531 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-217ENST00000550044 POTEGQ6S5H5 508 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-217ENST00000550044 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-217ENST00000550044 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.34■□□□□ 0.05
CS-217ENST00000550044 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CS-217ENST00000550044 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 PREX2Q70Z35 1606 aa15.32■□□□□ 0.04
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CS-217ENST00000550044 PLA2R1Q13018 1463 aa15.31■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 PIP4K2BP78356 416 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.3■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 ZMYM3Q14202 1370 aa15.29■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 PKD2Q13563 968 aa15.28■□□□□ 0.04
CS-217ENST00000550044 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.28■□□□□ 0.04
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CS-217ENST00000550044 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa15.23■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 PTPRKQ15262 1439 aa15.23■□□□□ 0.03
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CS-217ENST00000550044 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 METRNQ9UJH8 293 aa15.22■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 C7P10643 843 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 SLC39A7Q92504 469 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 CPS1P31327 1500 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.21■□□□□ 0.03
CS-217ENST00000550044 PLXNC1O60486 1568 aa15.19■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
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CS-217ENST00000550044 ATP7AQ04656 1500 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.18■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 A2MP01023 1474 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 GGT6Q6P531 493 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-217ENST00000550044 ALKQ9UM73 1620 aa15.15■□□□□ 0.02
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CS-217ENST00000550044 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.12■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.1■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.09■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
CS-217ENST00000550044 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.08■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 TNRQ92752 1358 aa15.08■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 TIAM1Q13009 1591 aa15.07■□□□□ 0
CS-217ENST00000550044 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
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