RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548759.1

DTX1-204, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 1, human

TSL 2

Gene DTX1, Length 940 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DTX1-204	ENST00000548759	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.17	■■■■■ 4.5
DTX1-204	ENST00000548759	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		43.15	■■■■■ 4.5
DTX1-204	ENST00000548759	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.15	■■■■■ 4.5
DTX1-204	ENST00000548759	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		43.12	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.1	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.1	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	ABCC5	O15440	1437 aa		43.09	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	TNR	Q92752	1358 aa		43.08	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		43.07	■■■■■ 4.49
DTX1-204	ENST00000548759	PZP	P20742	1482 aa		43.06	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.06	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	PKD2	Q13563	968 aa		43.03	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.02	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.01	■■■■■ 4.48
DTX1-204	ENST00000548759	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.99	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	DAPK1	P53355	1430 aa		42.98	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.97	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.97	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
DTX1-204	ENST00000548759	ABCC3	O15438	1527 aa		42.93	■■■■■ 4.46
DTX1-204	ENST00000548759	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
DTX1-204	ENST00000548759	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.9	■■■■■ 4.46
DTX1-204	ENST00000548759	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
DTX1-204	ENST00000548759	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.87	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.86	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.85	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.85	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.85	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.82	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
DTX1-204	ENST00000548759	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.79	■■■■■ 4.44
DTX1-204	ENST00000548759	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.78	■■■■■ 4.44
DTX1-204	ENST00000548759	CEP152	O94986	1710 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DTX1-204	ENST00000548759	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.74	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.73	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.73	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	KANK1	Q14678	1352 aa		42.71	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
DTX1-204	ENST00000548759	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.64	■■■■■ 4.42
DTX1-204	ENST00000548759	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
DTX1-204	ENST00000548759	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.62	■■■■■ 4.41
DTX1-204	ENST00000548759	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.62	■■■■■ 4.41
DTX1-204	ENST00000548759	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
DTX1-204	ENST00000548759	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.61	■■■■■ 4.41
DTX1-204	ENST00000548759	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.6	■■■■■ 4.41
DTX1-204	ENST00000548759	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
DTX1-204	ENST00000548759	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.52	■■■■■ 4.4
DTX1-204	ENST00000548759	MED14	O60244	1454 aa		42.5	■■■■■ 4.39
DTX1-204	ENST00000548759	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.5	■■■■■ 4.39
DTX1-204	ENST00000548759	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.48	■■■■■ 4.39
DTX1-204	ENST00000548759	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.47	■■■■■ 4.39
DTX1-204	ENST00000548759	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.45	■■■■■ 4.39
DTX1-204	ENST00000548759	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.44	■■■■■ 4.38
DTX1-204	ENST00000548759	ITGAE	P38570	1179 aa		42.44	■■■■■ 4.38
DTX1-204	ENST00000548759	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.43	■■■■■ 4.38
DTX1-204	ENST00000548759	IDI1	Q13907	227 aa		42.41	■■■■■ 4.38
DTX1-204	ENST00000548759	LTK	P29376	864 aa		42.4	■■■■■ 4.38
DTX1-204	ENST00000548759	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.37	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.37	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	CPS1	P31327	1500 aa		42.36	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.34	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.33	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.32	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.32	■■■■■ 4.37
DTX1-204	ENST00000548759	SLIT1	O75093	1534 aa		42.3	■■■■■ 4.36
DTX1-204	ENST00000548759	NOS1	P29475	1434 aa		42.3	■■■■■ 4.36
DTX1-204	ENST00000548759	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.28	■■■■■ 4.36
DTX1-204	ENST00000548759	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.28	■■■■■ 4.36
DTX1-204	ENST00000548759	SYNM	O15061	1565 aa		42.26	■■■■■ 4.36
DTX1-204	ENST00000548759	TOM1	O60784	492 aa		42.23	■■■■■ 4.35
DTX1-204	ENST00000548759	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
DTX1-204	ENST00000548759	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
DTX1-204	ENST00000548759	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DTX1-204	ENST00000548759	TET3	O43151	1660 aa		42.16	■■■■■ 4.34
DTX1-204	ENST00000548759	UNC13B	O14795	1591 aa		42.16	■■■■■ 4.34
DTX1-204	ENST00000548759	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
DTX1-204	ENST00000548759	NUP155	O75694	1391 aa		42.14	■■■■■ 4.34
DTX1-204	ENST00000548759	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DTX1-204	ENST00000548759	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DTX1-204	ENST00000548759	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DTX1-204	ENST00000548759	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DTX1-204	ENST00000548759	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.06	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.06	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.06	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	HSPA1L	P34931	641 aa		42.01	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.01	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.01	■■■■■ 4.32
DTX1-204	ENST00000548759	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
DTX1-204	ENST00000548759		E9PCH4	1651 aa		41.99	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms