RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 VWDEQ8N2E2 1590 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 AFAP1Q8N556 730 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.28□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.27□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 ERBINQ96RT1 1412 aa9.27□□□□□ -0.92
ANKRD49-208ENST00000544253 MED14O60244 1454 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 SYNMO15061 1565 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.27□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 ABCC3O15438 1527 aa9.26□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 ADGRL2O95490 1459 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 ZMYM3Q14202 1370 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 CPS1P31327 1500 aa9.25□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.22□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 PKD2Q13563 968 aa9.22□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 SLIT1O75093 1534 aa9.21□□□□□ -0.93
ANKRD49-208ENST00000544253 CEP152O94986 1710 aa9.21□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 UNC13BO14795 1591 aa9.21□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 CERKQ8TCT0 537 aa9.21□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 IQGAP1P46940 1657 aa9.2□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.2□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 ERVK-7P63135 1459 aa9.2□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 ARHGAP23Q9P227 1491 aa9.2□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.18□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.18□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.17□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 TET3O43151 1660 aa9.17□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 TNRQ92752 1358 aa9.17□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 DAPK1P53355 1430 aa9.17□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 PIK3C2BO00750 1634 aa9.16□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 MLECQ14165 292 aa9.16□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 ABCC5O15440 1437 aa9.16□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 HSPA2P54652 639 aa9.16□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 NWD1Q149M9 1564 aa9.15□□□□□ -0.94
ANKRD49-208ENST00000544253 IQGAP3Q86VI3 1631 aa9.14□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ADGRB3O60242 1522 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ROCK1Q13464 1354 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.13□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 DIP2AQ14689 1571 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 NOS1P29475 1434 aa9.12□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 TSPY4P0CV99 314 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 TSPY10P0CW01 314 aa9.11□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF15Q9NS87 1388 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.1□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 ALKQ9UM73 1620 aa9.09□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
ANKRD49-208ENST00000544253 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 KANK1Q14678 1352 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 E9PCH4 1651 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 KIF3BO15066 747 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.04□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.04□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.04□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.03□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 GGT6Q6P531 493 aa9.03□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 ZFYVE9O95405 1425 aa9.03□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.02□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.02□□□□□ -0.96
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.02□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.01□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa9.01□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 PIK3R4Q99570 1358 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 LAMC1P11047 1609 aa9□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 TRPM2O94759 1503 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 APLP2Q06481 763 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.99□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.97□□□□□ -0.97
ANKRD49-208ENST00000544253 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
ANKRD49-208ENST00000544253 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.96□□□□□ -0.98
ANKRD49-208ENST00000544253 DCCP43146 1447 aa8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms