RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542157.5

CD6-211, Transcript of CD6 molecule, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD6, Length 835 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6-211ENST00000542157 PKD2Q13563 968 aa35.5■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.5■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.5■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 MAP3K1Q13233 1512 aa35.49■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.47■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.46■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 TNRQ92752 1358 aa35.45■■■■□ 3.27
CD6-211ENST00000542157 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 PZPP20742 1482 aa35.42■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.42■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.4■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.4■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 MIA2Q96PC5 1412 aa35.39■■■■□ 3.26
CD6-211ENST00000542157 APLP2Q06481 763 aa35.35■■■■□ 3.25
CD6-211ENST00000542157 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
CD6-211ENST00000542157 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CD6-211ENST00000542157 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CD6-211ENST00000542157 ABCC3O15438 1527 aa35.27■■■■□ 3.24
CD6-211ENST00000542157 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 NLRP1Q9C000 1473 aa35.25■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.22■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.21■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.21■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.21■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.21■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.21■■■■□ 3.23
CD6-211ENST00000542157 CEP152O94986 1710 aa35.19■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.19■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.18■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.17■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 ABCC5O15440 1437 aa35.16■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 KIF15Q9NS87 1388 aa35.16■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.15■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.15■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.14■■■■□ 3.22
CD6-211ENST00000542157 ERVK-7P63135 1459 aa35.13■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 DAPK1P53355 1430 aa35.09■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.09■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 ERBINQ96RT1 1412 aa35.07■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 DEPDC5O75140 1603 aa35.07■■■■□ 3.21
CD6-211ENST00000542157 CPS1P31327 1500 aa35.06■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 MED14O60244 1454 aa35.04■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.02■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 IQGAP1P46940 1657 aa35.01■■■■□ 3.2
CD6-211ENST00000542157 VWDEQ8N2E2 1590 aa35■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.98■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.98■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 KANK1Q14678 1352 aa34.97■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.97■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 ILDR2Q71H61 639 aa34.95■■■■□ 3.19
CD6-211ENST00000542157 TOM1O60784 492 aa34.94■■■■□ 3.18
CD6-211ENST00000542157 PIP4K2BP78356 416 aa34.94■■■■□ 3.18
CD6-211ENST00000542157 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CD6-211ENST00000542157 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.86■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.85■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.84■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 PIK3C2BO00750 1634 aa34.84■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 LTKP29376 864 aa34.83■■■■□ 3.17
CD6-211ENST00000542157 SLIT1O75093 1534 aa34.82■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.82■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 HSPA1LP34931 641 aa34.81■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 EID1Q9Y6B2 187 aa34.81■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.81■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 ADGRL2O95490 1459 aa34.79■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.77■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 SYNMO15061 1565 aa34.76■■■■□ 3.16
CD6-211ENST00000542157 SOCS7O14512 581 aa34.74■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 IDI1Q13907 227 aa34.74■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.74■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.73■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.72■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 ALKQ9UM73 1620 aa34.7■■■■□ 3.15
CD6-211ENST00000542157 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
CD6-211ENST00000542157 NOS1P29475 1434 aa34.67■■■■□ 3.14
CD6-211ENST00000542157 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.62■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 ADGRB3O60242 1522 aa34.61■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 TET3O43151 1660 aa34.57■■■■□ 3.13
CD6-211ENST00000542157 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.56■■■■□ 3.12
CD6-211ENST00000542157 BCANQ96GW7 911 aa34.55■■■■□ 3.12
CD6-211ENST00000542157 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.53■■■■□ 3.12
CD6-211ENST00000542157 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.52■■■■□ 3.12
CD6-211ENST00000542157 UNC13BO14795 1591 aa34.52■■■■□ 3.12
CD6-211ENST00000542157 KCNA6P17658 529 aa34.5■■■■□ 3.11
CD6-211ENST00000542157 ROCK1Q13464 1354 aa34.49■■■■□ 3.11
CD6-211ENST00000542157 ITGAEP38570 1179 aa34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms