RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, human

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHBDD1-215	ENST00000539613	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	SOCS7	O14512	581 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	KIF3B	O15066	747 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	TNR	Q92752	1358 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RHBDD1-215	ENST00000539613	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RHBDD1-215	ENST00000539613	PZP	P20742	1482 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RHBDD1-215	ENST00000539613	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RHBDD1-215	ENST00000539613	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RHBDD1-215	ENST00000539613	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RHBDD1-215	ENST00000539613	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RHBDD1-215	ENST00000539613	CPS1	P31327	1500 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.11	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.09	■■■□□ 2.89
RHBDD1-215	ENST00000539613	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.07	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	CEP152	O94986	1710 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	ABCC3	O15438	1527 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RHBDD1-215	ENST00000539613	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	TOM1	O60784	492 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	HSPA1L	P34931	641 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RHBDD1-215	ENST00000539613	MED14	O60244	1454 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RHBDD1-215	ENST00000539613	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RHBDD1-215	ENST00000539613	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RHBDD1-215	ENST00000539613	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RHBDD1-215	ENST00000539613	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	SYNM	O15061	1565 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RHBDD1-215	ENST00000539613	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RHBDD1-215	ENST00000539613	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RHBDD1-215	ENST00000539613	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RHBDD1-215	ENST00000539613	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
RHBDD1-215	ENST00000539613	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RHBDD1-215	ENST00000539613	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RHBDD1-215	ENST00000539613	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	SLIT1	O75093	1534 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.65	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.65	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	ABCC5	O15440	1437 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RHBDD1-215	ENST00000539613	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	KANK1	Q14678	1352 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	DAPK1	P53355	1430 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	LTK	P29376	864 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	APLP2	Q06481	763 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RHBDD1-215	ENST00000539613	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RHBDD1-215	ENST00000539613	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RHBDD1-215	ENST00000539613	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RHBDD1-215	ENST00000539613	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RHBDD1-215	ENST00000539613	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RHBDD1-215	ENST00000539613	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RHBDD1-215	ENST00000539613	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RHBDD1-215	ENST00000539613	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RHBDD1-215	ENST00000539613	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RHBDD1-215	ENST00000539613	IDI1	Q13907	227 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RHBDD1-215	ENST00000539613	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RHBDD1-215	ENST00000539613	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	TET3	O43151	1660 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	NOS1	P29475	1434 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RHBDD1-215	ENST00000539613	KCNA6	P17658	529 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RHBDD1-215	ENST00000539613	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms