RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-202ENST00000535551 ABCC5O15440 1437 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 DAPK1P53355 1430 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 PTPRKQ15262 1439 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 MIER1Q8N108 512 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 BCL11AQ9H165 835 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.43■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PGA3-202ENST00000535551 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
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PGA3-202ENST00000535551 ADGRL2O95490 1459 aa15.38■□□□□ 0.05
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PGA3-202ENST00000535551 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.38■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 ERBINQ96RT1 1412 aa15.37■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 C3P01024 1663 aa15.36■□□□□ 0.05
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PGA3-202ENST00000535551 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
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PGA3-202ENST00000535551 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.35■□□□□ 0.05
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PGA3-202ENST00000535551 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.34■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 ITGAEP38570 1179 aa15.34■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.34■□□□□ 0.05
PGA3-202ENST00000535551 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.34■□□□□ 0.05
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PGA3-202ENST00000535551 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.32■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 ROCK1Q13464 1354 aa15.31■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 KIF3BO15066 747 aa15.3■□□□□ 0.04
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PGA3-202ENST00000535551 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.29■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 ZMYM3Q14202 1370 aa15.28■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 GGT6Q6P531 493 aa15.28■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.28■□□□□ 0.04
PGA3-202ENST00000535551 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.26■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 ABCC3O15438 1527 aa15.26■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 PZPP20742 1482 aa15.25■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.24■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa15.24■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.24■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.23■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.23■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.23■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 CEP152O94986 1710 aa15.22■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 KANK1Q14678 1352 aa15.22■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.21■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 UNC13BO14795 1591 aa15.21■□□□□ 0.03
PGA3-202ENST00000535551 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
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PGA3-202ENST00000535551 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.21■□□□□ 0.03
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PGA3-202ENST00000535551 HFM1A2PYH4 1435 aa15.17■□□□□ 0.02
PGA3-202ENST00000535551 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
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PGA3-202ENST00000535551 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.16■□□□□ 0.02
PGA3-202ENST00000535551 TET3O43151 1660 aa15.15■□□□□ 0.02
PGA3-202ENST00000535551 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PGA3-202ENST00000535551 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 ERVK-7P63135 1459 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 TNRQ92752 1358 aa15.14■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 PLA2R1Q13018 1463 aa15.13■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 STRCQ7RTU9 1775 aa15.1■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 HSPA2P54652 639 aa15.09■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
PGA3-202ENST00000535551 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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PGA3-202ENST00000535551 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.07■□□□□ 0
PGA3-202ENST00000535551 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.07■□□□□ 0
PGA3-202ENST00000535551 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
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PGA3-202ENST00000535551 NUP155O75694 1391 aa15.04■□□□□ -0
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PGA3-202ENST00000535551 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PGA3-202ENST00000535551 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
PGA3-202ENST00000535551 PIK3C2BO00750 1634 aa15.02□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 ADGRB3O60242 1522 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 SLIT1O75093 1534 aa14.99□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 MED14O60244 1454 aa14.98□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.98□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.97□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.96□□□□□ -0.01
PGA3-202ENST00000535551 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.95□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 ERICH6Q7L0X2 663 aa14.95□□□□□ -0.02
PGA3-202ENST00000535551 TRIM52Q96A61 297 aa14.95□□□□□ -0.02
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