RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.18■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF15Q9NS87 1388 aa25.18■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCOA1Q15788 1441 aa25.15■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MLECQ14165 292 aa25.14■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ROCK1Q13464 1354 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DEPDC5O75140 1603 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C3P01024 1663 aa25.11■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.1■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.08■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTPRKQ15262 1439 aa25.07■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF3BO15066 747 aa25.05■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.03■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GGT6Q6P531 493 aa25.01■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.01■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC3O15438 1527 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NPATQ14207 1427 aa24.98■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP152O94986 1710 aa24.98■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UNC13BO14795 1591 aa24.97■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.96■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.96■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMYM3Q14202 1370 aa24.95■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PZPP20742 1482 aa24.94■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.93■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.92■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KANK1Q14678 1352 aa24.91■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITGAEP38570 1179 aa24.9■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HFM1A2PYH4 1435 aa24.88■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NAIPQ13075 1403 aa24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.86■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.85■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TET3O43151 1660 aa24.85■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.84■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERVK-7P63135 1459 aa24.79■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.551e-6■□□□□ 8.7
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNRQ92752 1358 aa24.76■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NLRP1Q9C000 1473 aa24.76■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.72■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-211ENST00000533653 E9PCH4 1651 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NUP155O75694 1391 aa24.69■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOS1P29475 1434 aa24.67■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLA2R1Q13018 1463 aa24.65■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYNMO15061 1565 aa24.65■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.63■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.62■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STRCQ7RTU9 1775 aa24.62■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.61■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.61■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIK3C2BO00750 1634 aa24.61■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HSPA2P54652 639 aa24.59■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ADGRB3O60242 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.53■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRPM2O94759 1503 aa24.52■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PTPRTO14522 1441 aa24.52■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.51■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.51■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLIT1O75093 1534 aa24.5■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM52Q96A61 297 aa24.49■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PKD2Q13563 968 aa24.48■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.48■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HRCP23327 699 aa24.47■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.46■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.46■■□□□ 1.51
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.45■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IDI1Q13907 227 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MED14O60244 1454 aa24.43■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CLTCL1P53675 1640 aa24.42■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KIF1BO60333 1816 aa24.41■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IQGAP1P46940 1657 aa24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.4■■□□□ 1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.38■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.38■■□□□ 1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.37■■□□□ 1.49
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