RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.72
PKP3-209ENST00000533069 PTPRKQ15262 1439 aa25.76■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 KIF15Q9NS87 1388 aa25.75■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.73■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 ERBINQ96RT1 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.7■■□□□ 1.71
PKP3-209ENST00000533069 PZPP20742 1482 aa25.69■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.68■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.66■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 ADGRL2O95490 1459 aa25.66■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 ABCC3O15438 1527 aa25.65■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.65■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 NCOA1Q15788 1441 aa25.64■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.64■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.64■■□□□ 1.7
PKP3-209ENST00000533069 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 TNRQ92752 1358 aa25.61■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.59■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 STRCQ7RTU9 1775 aa25.58■■□□□ 1.69
PKP3-209ENST00000533069 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.57■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 DEPDC5O75140 1603 aa25.56■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 PTPRTO14522 1441 aa25.56■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 PLA2R1Q13018 1463 aa25.56■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 28.3
PKP3-209ENST00000533069 KANK1Q14678 1352 aa25.55■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 NLRP1Q9C000 1473 aa25.53■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.52■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.52■■□□□ 1.68
PKP3-209ENST00000533069 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.51■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 ERVK-7P63135 1459 aa25.51■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 CEP152O94986 1710 aa25.5■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 ROCK1Q13464 1354 aa25.5■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 PKD2Q13563 968 aa25.5■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.48■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.47■■□□□ 1.67
PKP3-209ENST00000533069 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.43■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.43■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 FBXO41Q8TF61 875 aa25.42■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 CERKQ8TCT0 537 aa25.4■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 ITGAEP38570 1179 aa25.39■■□□□ 1.66
PKP3-209ENST00000533069 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.38■■□□□ 1.65
PKP3-209ENST00000533069 UNC13BO14795 1591 aa25.35■■□□□ 1.65
PKP3-209ENST00000533069 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.34■■□□□ 1.65
PKP3-209ENST00000533069 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PKP3-209ENST00000533069 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.31■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.3■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 NOS1P29475 1434 aa25.3■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 TET3O43151 1660 aa25.29■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 MED14O60244 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.27■■□□□ 1.64
PKP3-209ENST00000533069 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 SYNMO15061 1565 aa25.25■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.24■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.24■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 SLIT1O75093 1534 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 NUP155O75694 1391 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 PIK3C2BO00750 1634 aa25.23■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 IDI1Q13907 227 aa25.22■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.22■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.21■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PKP3-209ENST00000533069 NAIPQ13075 1403 aa25.19■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.18■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 ADGRB3O60242 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 IQGAP1P46940 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 EID1Q9Y6B2 187 aa25.17■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 HFM1A2PYH4 1435 aa25.16■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.15■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 CPS1P31327 1500 aa25.14■■□□□ 1.62
PKP3-209ENST00000533069 E9PCH4 1651 aa25.13■■□□□ 1.61
PKP3-209ENST00000533069 LTKP29376 864 aa25.13■■□□□ 1.61
PKP3-209ENST00000533069 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.04■■□□□ 1.6
PKP3-209ENST00000533069 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PKP3-209ENST00000533069 ZFYVE9O95405 1425 aa25.02■■□□□ 1.6
PKP3-209ENST00000533069 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.98■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 TRIM52Q96A61 297 aa24.98■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.97■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.96■■□□□ 1.59
PKP3-209ENST00000533069 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms