RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532471.1

ME3-210, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 2

Gene ME3, Length 384 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-210ENST00000532471 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.4■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 KIF15Q9NS87 1388 aa35.4■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.4■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 NPATQ14207 1427 aa35.4■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.39■■■■□ 3.26
ME3-210ENST00000532471 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.34■■■■□ 3.25
ME3-210ENST00000532471 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.34■■■■□ 3.25
ME3-210ENST00000532471 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.31■■■■□ 3.24
ME3-210ENST00000532471 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
ME3-210ENST00000532471 PTPRKQ15262 1439 aa35.3■■■■□ 3.24
ME3-210ENST00000532471 NCOA1Q15788 1441 aa35.28■■■■□ 3.24
ME3-210ENST00000532471 ERBINQ96RT1 1412 aa35.28■■■■□ 3.24
ME3-210ENST00000532471 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.24■■■■□ 3.23
ME3-210ENST00000532471 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
ME3-210ENST00000532471 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
ME3-210ENST00000532471 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ME3-210ENST00000532471 ADGRL2O95490 1459 aa35.19■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 PZPP20742 1482 aa35.19■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 KANK1Q14678 1352 aa35.18■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.18■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 ITGAEP38570 1179 aa35.17■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 TNRQ92752 1358 aa35.15■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 ABCC3O15438 1527 aa35.14■■■■□ 3.22
ME3-210ENST00000532471 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
ME3-210ENST00000532471 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.09■■■■□ 3.21
ME3-210ENST00000532471 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.09■■■■□ 3.21
ME3-210ENST00000532471 ROCK1Q13464 1354 aa35.08■■■■□ 3.21
ME3-210ENST00000532471 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.06■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.04■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.02■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 PKD2Q13563 968 aa35.01■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
ME3-210ENST00000532471 STRCQ7RTU9 1775 aa35■■■■□ 3.19
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ME3-210ENST00000532471 DEPDC5O75140 1603 aa35■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 CEP152O94986 1710 aa35■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.99■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 NLRP1Q9C000 1473 aa34.99■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.98■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 PTPRTO14522 1441 aa34.98■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 ERVK-7P63135 1459 aa34.95■■■■□ 3.19
ME3-210ENST00000532471 PLA2R1Q13018 1463 aa34.94■■■■□ 3.18
ME3-210ENST00000532471 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.93■■■■□ 3.18
ME3-210ENST00000532471 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.91■■■■□ 3.18
ME3-210ENST00000532471 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
ME3-210ENST00000532471 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.89■■■■□ 3.18
ME3-210ENST00000532471 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.88■■■■□ 3.17
ME3-210ENST00000532471 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.87■■■■□ 3.17
ME3-210ENST00000532471 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP34.84■■■■□ 3.17
ME3-210ENST00000532471 CERKQ8TCT0 537 aa34.83■■■■□ 3.17
ME3-210ENST00000532471 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.82■■■■□ 3.16
ME3-210ENST00000532471 NUP155O75694 1391 aa34.78■■■■□ 3.16
ME3-210ENST00000532471 FBXO41Q8TF61 875 aa34.78■■■■□ 3.16
ME3-210ENST00000532471 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.76■■■■□ 3.16
ME3-210ENST00000532471 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.75■■■■□ 3.15
ME3-210ENST00000532471 UNC13BO14795 1591 aa34.74■■■■□ 3.15
ME3-210ENST00000532471 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
ME3-210ENST00000532471 IDI1Q13907 227 aa34.74■■■■□ 3.15
ME3-210ENST00000532471 NOS1P29475 1434 aa34.7■■■■□ 3.15
ME3-210ENST00000532471 EID1Q9Y6B2 187 aa34.69■■■■□ 3.14
ME3-210ENST00000532471 TET3O43151 1660 aa34.69■■■■□ 3.14
ME3-210ENST00000532471 NAIPQ13075 1403 aa34.66■■■■□ 3.14
ME3-210ENST00000532471 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.66■■■■□ 3.14
ME3-210ENST00000532471 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.63■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.63■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.63■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.62■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 MED14O60244 1454 aa34.6■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 TRIM52Q96A61 297 aa34.6■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 HFM1A2PYH4 1435 aa34.6■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 PIK3C2BO00750 1634 aa34.59■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 SYNMO15061 1565 aa34.59■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.58■■■■□ 3.13
ME3-210ENST00000532471 LTKP29376 864 aa34.57■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.57■■■■□ 3.12
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ME3-210ENST00000532471 SLIT1O75093 1534 aa34.55■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.54■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 E9PCH4 1651 aa34.52■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
ME3-210ENST00000532471 IQGAP1P46940 1657 aa34.47■■■■□ 3.11
ME3-210ENST00000532471 ADGRB3O60242 1522 aa34.46■■■■□ 3.11
ME3-210ENST00000532471 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.45■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 BCANQ96GW7 911 aa34.43■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.41■■■■□ 3.1
ME3-210ENST00000532471 CPS1P31327 1500 aa34.38■■■■□ 3.09
ME3-210ENST00000532471 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.34■■■■□ 3.09
ME3-210ENST00000532471 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.34■■■■□ 3.09
ME3-210ENST00000532471 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.31■■■■□ 3.08
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