RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530628.2

CDKN2A-210, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDKN2A, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-210ENST00000530628 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.89■■■■□ 3.18
CDKN2A-210ENST00000530628 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.88■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.87■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.87■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.86■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 MAP3K1Q13233 1512 aa34.83■■■■□ 3.17
CDKN2A-210ENST00000530628 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 TNRQ92752 1358 aa34.81■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 PZPP20742 1482 aa34.81■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.78■■■■□ 3.16
CDKN2A-210ENST00000530628 MIA2Q96PC5 1412 aa34.74■■■■□ 3.15
CDKN2A-210ENST00000530628 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
CDKN2A-210ENST00000530628 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.73■■■■□ 3.15
CDKN2A-210ENST00000530628 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
CDKN2A-210ENST00000530628 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CDKN2A-210ENST00000530628 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
CDKN2A-210ENST00000530628 NLRP1Q9C000 1473 aa34.65■■■■□ 3.14
CDKN2A-210ENST00000530628 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.65■■■■□ 3.14
CDKN2A-210ENST00000530628 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
CDKN2A-210ENST00000530628 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.63■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 APLP2Q06481 763 aa34.63■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.62■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.62■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.62■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC3O15438 1527 aa34.61■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.58■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.13
CDKN2A-210ENST00000530628 CEP152O94986 1710 aa34.57■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.55■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.55■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.54■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.54■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 DEPDC5O75140 1603 aa34.52■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 CPS1P31327 1500 aa34.51■■■■□ 3.12
CDKN2A-210ENST00000530628 ERVK-7P63135 1459 aa34.5■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.5■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 ABCC5O15440 1437 aa34.48■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 MED14O60244 1454 aa34.48■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 KIF15Q9NS87 1388 aa34.48■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.46■■■■□ 3.11
CDKN2A-210ENST00000530628 IQGAP1P46940 1657 aa34.44■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ILDR2Q71H61 639 aa34.44■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 ERBINQ96RT1 1412 aa34.44■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.43■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 DAPK1P53355 1430 aa34.42■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.4■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.4■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 TOM1O60784 492 aa34.39■■■■□ 3.1
CDKN2A-210ENST00000530628 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CDKN2A-210ENST00000530628 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.37■■■■□ 3.09
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.37■■■■□ 3.09
CDKN2A-210ENST00000530628 PIP4K2BP78356 416 aa34.34■■■■□ 3.09
CDKN2A-210ENST00000530628 KANK1Q14678 1352 aa34.33■■■■□ 3.09
CDKN2A-210ENST00000530628 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.32■■■■□ 3.08
CDKN2A-210ENST00000530628 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.32■■■■□ 3.08
CDKN2A-210ENST00000530628 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.28■■■■□ 3.08
CDKN2A-210ENST00000530628 SOCS7O14512 581 aa34.27■■■■□ 3.08
CDKN2A-210ENST00000530628 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
CDKN2A-210ENST00000530628 HSPA1LP34931 641 aa34.24■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.24■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 SLIT1O75093 1534 aa34.24■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.23■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 PIK3C2BO00750 1634 aa34.22■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 LTKP29376 864 aa34.21■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.21■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 SYNMO15061 1565 aa34.2■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 EID1Q9Y6B2 187 aa34.2■■■■□ 3.07
CDKN2A-210ENST00000530628 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.2■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.2■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 ALKQ9UM73 1620 aa34.15■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 ADGRL2O95490 1459 aa34.14■■■■□ 3.06
CDKN2A-210ENST00000530628 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.12■■■■□ 3.05
CDKN2A-210ENST00000530628 IDI1Q13907 227 aa34.11■■■■□ 3.05
CDKN2A-210ENST00000530628 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.1■■■■□ 3.05
CDKN2A-210ENST00000530628 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
CDKN2A-210ENST00000530628 NOS1P29475 1434 aa34.04■■■■□ 3.04
CDKN2A-210ENST00000530628 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.04■■■■□ 3.04
CDKN2A-210ENST00000530628 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
CDKN2A-210ENST00000530628 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.01■■■■□ 3.03
CDKN2A-210ENST00000530628 ADGRB3O60242 1522 aa33.99■■■■□ 3.03
CDKN2A-210ENST00000530628 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CDKN2A-210ENST00000530628 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CDKN2A-210ENST00000530628 TET3O43151 1660 aa33.95■■■■□ 3.03
CDKN2A-210ENST00000530628 KCNA6P17658 529 aa33.92■■■■□ 3.02
CDKN2A-210ENST00000530628 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.92■■■■□ 3.02
CDKN2A-210ENST00000530628 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.91■■■■□ 3.02
CDKN2A-210ENST00000530628 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.91■■■■□ 3.02
CDKN2A-210ENST00000530628 BCANQ96GW7 911 aa33.89■■■■□ 3.02
CDKN2A-210ENST00000530628 UNC13BO14795 1591 aa33.88■■■■□ 3.01
CDKN2A-210ENST00000530628 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
CDKN2A-210ENST00000530628 TMEM94Q12767 1356 aa33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms