RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530301.5

RDX-210, Transcript of radixin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDX, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDX-210ENST00000530301 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
RDX-210ENST00000530301 RICTORQ6R327 1708 aa37.55■■■■□ 3.6
RDX-210ENST00000530301 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.53■■■■□ 3.6
RDX-210ENST00000530301 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
RDX-210ENST00000530301 FOXD1Q16676 465 aa37.51■■■■□ 3.6
RDX-210ENST00000530301 A2MP01023 1474 aa37.51■■■■□ 3.59
RDX-210ENST00000530301 KANK1Q14678 1352 aa37.5■■■■□ 3.59
RDX-210ENST00000530301 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.596e-8■■■□□ 16.9
RDX-210ENST00000530301 TSPOAP1O95153 1857 aa37.45■■■■□ 3.59
RDX-210ENST00000530301 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.45■■■■□ 3.59
RDX-210ENST00000530301 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.45■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 RAPGEF3O95398 923 aa37.42■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.41■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 KIF3BO15066 747 aa37.41■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 ATP10AO60312 1499 aa37.39■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 ABCA6Q8N139 1617 aa37.38■■■■□ 3.58
RDX-210ENST00000530301 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
RDX-210ENST00000530301 TET3O43151 1660 aa37.36■■■■□ 3.57
RDX-210ENST00000530301 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.35■■■■□ 3.57
RDX-210ENST00000530301 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.35■■■■□ 3.57
RDX-210ENST00000530301 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.31■■■■□ 3.56
RDX-210ENST00000530301 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.29■■■■□ 3.56
RDX-210ENST00000530301 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.29■■■■□ 3.56
RDX-210ENST00000530301 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.29■■■■□ 3.56
RDX-210ENST00000530301 E9PCH4 1651 aa37.23■■■■□ 3.55
RDX-210ENST00000530301 REREQ9P2R6 1566 aa37.22■■■■□ 3.55
RDX-210ENST00000530301 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.2■■■■□ 3.55
RDX-210ENST00000530301 PLA2R1Q13018 1463 aa37.18■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 PTPRTO14522 1441 aa37.17■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.16■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 TRPM2O94759 1503 aa37.15■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.14■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.14■■■■□ 3.54
RDX-210ENST00000530301 AGLP35573 1532 aa37.11■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.11■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.09■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.07■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 GGT6Q6P531 493 aa37.07■■■■□ 3.53
RDX-210ENST00000530301 CEP152O94986 1710 aa37.07■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.04■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.04■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 STAC3Q96MF2 364 aa37.04■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 ABCC3O15438 1527 aa37.03■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.02■■■■□ 3.52
RDX-210ENST00000530301 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.98■■■■□ 3.51
RDX-210ENST00000530301 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.96■■■■□ 3.51
RDX-210ENST00000530301 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.95■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.92■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.92■■■■□ 3.51e-35■■■■■ 36.1
RDX-210ENST00000530301 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.92■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.91■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 CLTCL1P53675 1640 aa36.91■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 NPATQ14207 1427 aa36.9■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.9■■■■□ 3.5
RDX-210ENST00000530301 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.87■■■■□ 3.49
RDX-210ENST00000530301 KIF1BO60333 1816 aa36.86■■■■□ 3.49
RDX-210ENST00000530301 RGL3Q3MIN7 710 aa36.82■■■■□ 3.48
RDX-210ENST00000530301 NOS1P29475 1434 aa36.81■■■■□ 3.48
RDX-210ENST00000530301 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.8■■■■□ 3.48
RDX-210ENST00000530301 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.8■■■■□ 3.48
RDX-210ENST00000530301 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
RDX-210ENST00000530301 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
RDX-210ENST00000530301 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.72■■■■□ 3.47
RDX-210ENST00000530301 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.7■■■■□ 3.47
RDX-210ENST00000530301 PIK3C2BO00750 1634 aa36.68■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 LAMC1P11047 1609 aa36.68■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 ADGRB3O60242 1522 aa36.67■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.66■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.66■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.65■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.65■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.65■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 MYOM2P54296 1465 aa36.65■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.64■■■■□ 3.46
RDX-210ENST00000530301 USP47Q96K76 1375 aa36.63■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 SYNMO15061 1565 aa36.62■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 MADDQ8WXG6 1647 aa36.6■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 IFT172Q9UG01 1749 aa36.58■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.58■■■■□ 3.45
RDX-210ENST00000530301 ERVK-7P63135 1459 aa36.55■■■■□ 3.44
RDX-210ENST00000530301 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
RDX-210ENST00000530301 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
RDX-210ENST00000530301 MROH2AA6NES4 1674 aa36.55■■■■□ 3.44
RDX-210ENST00000530301 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.51■■■■□ 3.44
RDX-210ENST00000530301 MLECQ14165 292 aa36.49■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.49■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 PPLO60437 1756 aa36.48■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 IDI1Q13907 227 aa36.46■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 ZMYM3Q14202 1370 aa36.45■■■■□ 3.43
RDX-210ENST00000530301 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.43■■■■□ 3.42
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