RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528247.1

ARHGEF4-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF4, Length 662 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-215ENST00000528247 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.65■■■□□ 2.18
ARHGEF4-215ENST00000528247 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF3BO15066 747 aa28.62■■■□□ 2.17
ARHGEF4-215ENST00000528247 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ARHGEF4-215ENST00000528247 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.59■■■□□ 2.17
ARHGEF4-215ENST00000528247 TNRQ92752 1358 aa28.57■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 PZPP20742 1482 aa28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.56■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.55■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.54■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 TOM1O60784 492 aa28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.53■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.52■■■□□ 2.16
ARHGEF4-215ENST00000528247 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 CPS1P31327 1500 aa28.49■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 HSPA1LP34931 641 aa28.47■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 TSPY4P0CV99 314 aa28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 TSPY10P0CW01 314 aa28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 PIP4K2BP78356 416 aa28.46■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 MIA2Q96PC5 1412 aa28.45■■■□□ 2.15
ARHGEF4-215ENST00000528247 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.43■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 NLRP1Q9C000 1473 aa28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.41■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC3O15438 1527 aa28.38■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 DEPDC5O75140 1603 aa28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 MED14O60244 1454 aa28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF4-215ENST00000528247 MAP3K1Q13233 1512 aa28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 ERVK-7P63135 1459 aa28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 IQGAP1P46940 1657 aa28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 CEP152O94986 1710 aa28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF4-215ENST00000528247 ALKQ9UM73 1620 aa28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF4-215ENST00000528247 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4-215ENST00000528247 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4-215ENST00000528247 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF4-215ENST00000528247 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.21■■■□□ 2.11
ARHGEF4-215ENST00000528247 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 KIF15Q9NS87 1388 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 ABCC5O15440 1437 aa28.17■■■□□ 2.1
ARHGEF4-215ENST00000528247 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.14■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 SYNMO15061 1565 aa28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 ERBINQ96RT1 1412 aa28.12■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 LTKP29376 864 aa28.11■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 SLIT1O75093 1534 aa28.1■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 DAPK1P53355 1430 aa28.08■■■□□ 2.09
ARHGEF4-215ENST00000528247 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4-215ENST00000528247 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4-215ENST00000528247 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
ARHGEF4-215ENST00000528247 PIK3C2BO00750 1634 aa28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF4-215ENST00000528247 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF4-215ENST00000528247 APLP2Q06481 763 aa28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 KANK1Q14678 1352 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 EID1Q9Y6B2 187 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.99■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.98■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.97■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.96■■■□□ 2.07
ARHGEF4-215ENST00000528247 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 IDI1Q13907 227 aa27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.94■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 NOS1P29475 1434 aa27.89■■■□□ 2.06
ARHGEF4-215ENST00000528247 TET3O43151 1660 aa27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.87■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADGRL2O95490 1459 aa27.86■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 ADGRB3O60242 1522 aa27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 TMEM94Q12767 1356 aa27.85■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.84■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 KCNA6P17658 529 aa27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF4-215ENST00000528247 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.78■■■□□ 2.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 NWD1Q149M9 1564 aa27.77■■■□□ 2.04
ARHGEF4-215ENST00000528247 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.76■■■□□ 2.04
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