RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528016.1

ACADM-211, Transcript of acyl-CoA dehydrogenase medium chain, humanhuman

TSL 4

Gene ACADM, Length 546 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADM-211ENST00000528016 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.42■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 CEP162Q5TB80 1403 aa29.41■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 TNRQ92752 1358 aa29.4■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 KIF3BO15066 747 aa29.4■■■□□ 2.3
ACADM-211ENST00000528016 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.37■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.36■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 PZPP20742 1482 aa29.36■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.36■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 PIP4K2BP78356 416 aa29.33■■■□□ 2.29
ACADM-211ENST00000528016 NCOA2Q15596 1464 aa29.32■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.31■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 HSPA1LP34931 641 aa29.31■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 CPS1P31327 1500 aa29.3■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.3■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.29■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.26■■■□□ 2.28
ACADM-211ENST00000528016 MIA2Q96PC5 1412 aa29.25■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.24■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.24■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 TOM1O60784 492 aa29.23■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 NLRP1Q9C000 1473 aa29.22■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.22■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
ACADM-211ENST00000528016 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.2■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 DEPDC5O75140 1603 aa29.2■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 ALKQ9UM73 1620 aa29.2■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 MED14O60244 1454 aa29.17■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 IQGAP1P46940 1657 aa29.17■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.16■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 TSPY4P0CV99 314 aa29.15■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 TSPY10P0CW01 314 aa29.15■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 ABCC3O15438 1527 aa29.15■■■□□ 2.26
ACADM-211ENST00000528016 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.09■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 CEP152O94986 1710 aa29.08■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 ERVK-7P63135 1459 aa29.08■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.08■■■□□ 2.25
ACADM-211ENST00000528016 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.06■■■□□ 2.24
ACADM-211ENST00000528016 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.06■■■□□ 2.24
ACADM-211ENST00000528016 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ACADM-211ENST00000528016 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.03■■■□□ 2.24
ACADM-211ENST00000528016 SYNMO15061 1565 aa29.01■■■□□ 2.24
ACADM-211ENST00000528016 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
ACADM-211ENST00000528016 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.98■■■□□ 2.23
ACADM-211ENST00000528016 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
ACADM-211ENST00000528016 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.93■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.93■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 LTKP29376 864 aa28.92■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.9■■■□□ 2.22
ACADM-211ENST00000528016 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.88■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 SLIT1O75093 1534 aa28.88■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.86■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 KIF15Q9NS87 1388 aa28.86■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 PIK3C2BO00750 1634 aa28.85■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.85■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.84■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 MAP3K1Q13233 1512 aa28.84■■■□□ 2.21
ACADM-211ENST00000528016 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.82■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.23e-7■■□□□ 13.1
ACADM-211ENST00000528016 ABCC5O15440 1437 aa28.8■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 ERBINQ96RT1 1412 aa28.79■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 EID1Q9Y6B2 187 aa28.77■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.76■■■□□ 2.2
ACADM-211ENST00000528016 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.75■■■□□ 2.19
ACADM-211ENST00000528016 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.73■■■□□ 2.19
ACADM-211ENST00000528016 DAPK1P53355 1430 aa28.72■■■□□ 2.19
ACADM-211ENST00000528016 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.71■■■□□ 2.19
ACADM-211ENST00000528016 TMEM94Q12767 1356 aa28.7■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 IDI1Q13907 227 aa28.69■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 KANK1Q14678 1352 aa28.69■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.68■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.67■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.66■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.65■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 TET3O43151 1660 aa28.65■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.65■■■□□ 2.18
ACADM-211ENST00000528016 KCNA6P17658 529 aa28.63■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.62■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 ADGRB3O60242 1522 aa28.6■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 NOS1P29475 1434 aa28.6■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 POTEAQ6S8J7 498 aa28.59■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.59■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 NWD1Q149M9 1564 aa28.58■■■□□ 2.17
ACADM-211ENST00000528016 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.55■■■□□ 2.16
ACADM-211ENST00000528016 APLP2Q06481 763 aa28.54■■■□□ 2.16
ACADM-211ENST00000528016 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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