RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525786.1

CCDC82-204, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC82, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-204ENST00000525786 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CCDC82-204ENST00000525786 TNRQ92752 1358 aa27.59■■■□□ 2.01
CCDC82-204ENST00000525786 DEPDC5O75140 1603 aa27.58■■■□□ 2.01
CCDC82-204ENST00000525786 SYNMO15061 1565 aa27.56■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 IQGAP1P46940 1657 aa27.56■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.55■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 PZPP20742 1482 aa27.54■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.54■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.54■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 MED14O60244 1454 aa27.52■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CCDC82-204ENST00000525786 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 26e-8■□□□□ 11.1
CCDC82-204ENST00000525786 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.51■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.51■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.5■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 NLRP1Q9C000 1473 aa27.49■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CCDC82-204ENST00000525786 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.45■■□□□ 1.98
CCDC82-204ENST00000525786 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.45■■□□□ 1.98
CCDC82-204ENST00000525786 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CCDC82-204ENST00000525786 MIA2Q96PC5 1412 aa27.4■■□□□ 1.98
CCDC82-204ENST00000525786 TIAM1Q13009 1591 aa27.39■■□□□ 1.98
CCDC82-204ENST00000525786 KIF3BO15066 747 aa27.38■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.38■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 MBD5Q9P267 1494 aa27.38■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.36■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CCDC82-204ENST00000525786 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CCDC82-204ENST00000525786 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.3■■□□□ 1.96
CCDC82-204ENST00000525786 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CCDC82-204ENST00000525786 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.29■■□□□ 1.96
CCDC82-204ENST00000525786 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.25■■□□□ 1.95
CCDC82-204ENST00000525786 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CCDC82-204ENST00000525786 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CCDC82-204ENST00000525786 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.2■■□□□ 1.95
CCDC82-204ENST00000525786 ABCC3O15438 1527 aa27.2■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 POTEAQ6S8J7 498 aa27.19■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 ERVK-7P63135 1459 aa27.19■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 CEP162Q5TB80 1403 aa27.17■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.16■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.14■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 CEP152O94986 1710 aa27.14■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CCDC82-204ENST00000525786 SLIT1O75093 1534 aa27.12■■□□□ 1.93
CCDC82-204ENST00000525786 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.11■■□□□ 1.93
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.09■■□□□ 1.93
CCDC82-204ENST00000525786 NCOA2Q15596 1464 aa27.08■■□□□ 1.93
CCDC82-204ENST00000525786 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 TSPY4P0CV99 314 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 TSPY10P0CW01 314 aa27.06■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 PHLPP1O60346 1717 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 EID1Q9Y6B2 187 aa27.03■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 LTKP29376 864 aa27.02■■□□□ 1.92
CCDC82-204ENST00000525786 TMEM94Q12767 1356 aa27.01■■□□□ 1.91
CCDC82-204ENST00000525786 MAP3K1Q13233 1512 aa27■■□□□ 1.91
CCDC82-204ENST00000525786 PIK3C2BO00750 1634 aa26.99■■□□□ 1.91
CCDC82-204ENST00000525786 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
CCDC82-204ENST00000525786 JCADQ9P266 1359 aa26.93■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.92■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 NWD1Q149M9 1564 aa26.91■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.9■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 KCNA6P17658 529 aa26.89■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.89■■□□□ 1.9
CCDC82-204ENST00000525786 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.89■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.89■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 MSH6P52701 1360 aa26.88■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 TET3O43151 1660 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CCDC82-204ENST00000525786 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 LRP6O75581 1613 aa26.8■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 TRIM52Q96A61 297 aa26.8■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.8■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 SLAIN2Q9P270 581 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 SHPRHQ149N8 1683 aa26.79■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.78■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 ERBINQ96RT1 1412 aa26.77■■□□□ 1.88
CCDC82-204ENST00000525786 ADGRB3O60242 1522 aa26.75■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.75■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 KANK1Q14678 1352 aa26.72■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 KIF15Q9NS87 1388 aa26.71■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 BCANQ96GW7 911 aa26.71■■□□□ 1.87
CCDC82-204ENST00000525786 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms