RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.69■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 DAPK1P53355 1430 aa31.67■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 STRCQ7RTU9 1775 aa31.66■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.65■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PTDSS2-202ENST00000525059 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.62■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 PZPP20742 1482 aa31.62■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF15Q9NS87 1388 aa31.62■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 PTPRTO14522 1441 aa31.6■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 NCOA1Q15788 1441 aa31.6■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.59■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 ERBINQ96RT1 1412 aa31.58■■■□□ 2.65
PTDSS2-202ENST00000525059 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.57■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 FBXO41Q8TF61 875 aa31.55■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 TNRQ92752 1358 aa31.55■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.55■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.54■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCC3O15438 1527 aa31.54■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.53■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.52■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 PLA2R1Q13018 1463 aa31.52■■■□□ 2.64
PTDSS2-202ENST00000525059 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.51■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.5■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRL2O95490 1459 aa31.48■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 PKD2Q13563 968 aa31.48■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 CERKQ8TCT0 537 aa31.48■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
PTDSS2-202ENST00000525059 NLRP1Q9C000 1473 aa31.45■■■□□ 2.62
PTDSS2-202ENST00000525059 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.44■■■□□ 2.62
PTDSS2-202ENST00000525059 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.42■■■□□ 2.62
PTDSS2-202ENST00000525059 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.4■■■□□ 2.62
PTDSS2-202ENST00000525059 DEPDC5O75140 1603 aa31.4■■■□□ 2.62
PTDSS2-202ENST00000525059 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 ERVK-7P63135 1459 aa31.38■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 KANK1Q14678 1352 aa31.37■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.36■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 CEP152O94986 1710 aa31.35■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.33■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.33■■■□□ 2.61
PTDSS2-202ENST00000525059 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.32■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.31■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.31■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 ROCK1Q13464 1354 aa31.3■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.28■■■□□ 2.6
PTDSS2-202ENST00000525059 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.21■■■□□ 2.59
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
PTDSS2-202ENST00000525059 MED14O60244 1454 aa31.21■■■□□ 2.59
PTDSS2-202ENST00000525059 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.2■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.16■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 NOS1P29475 1434 aa31.15■■■□□ 2.58
PTDSS2-202ENST00000525059 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.12■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 ITGAEP38570 1179 aa31.11■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 IDI1Q13907 227 aa31.11■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.1■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 UNC13BO14795 1591 aa31.09■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 SLIT1O75093 1534 aa31.08■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.08■■■□□ 2.57
PTDSS2-202ENST00000525059 SYNMO15061 1565 aa31.05■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 TET3O43151 1660 aa31.04■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 LTKP29376 864 aa31.04■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 PIK3C2BO00750 1634 aa31.04■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.03■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.03■■■□□ 2.56
PTDSS2-202ENST00000525059 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.01■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 EID1Q9Y6B2 187 aa31.01■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 IQGAP1P46940 1657 aa31■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 CPS1P31327 1500 aa31■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 NUP155O75694 1391 aa30.98■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.97■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.97■■■□□ 2.55
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRB3O60242 1522 aa30.92■■■□□ 2.54
PTDSS2-202ENST00000525059 NAIPQ13075 1403 aa30.9■■■□□ 2.54
PTDSS2-202ENST00000525059 E9PCH4 1651 aa30.89■■■□□ 2.54
PTDSS2-202ENST00000525059 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.87■■■□□ 2.53
PTDSS2-202ENST00000525059 HFM1A2PYH4 1435 aa30.83■■■□□ 2.53
PTDSS2-202ENST00000525059 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 ZFYVE9O95405 1425 aa30.81■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.8■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.79■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.78■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 TOM1O60784 492 aa30.78■■■□□ 2.52
PTDSS2-202ENST00000525059 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.75■■■□□ 2.51
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.74■■■□□ 2.51
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.73■■■□□ 2.51
PTDSS2-202ENST00000525059 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms