RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.99□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.99□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.99□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.98□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.98□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 TNRQ92752 1358 aa14.98□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 PZPP20742 1482 aa14.97□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
MSC-AS1-210ENST00000524152 MAP3K1Q13233 1512 aa14.96□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 MIA2Q96PC5 1412 aa14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.91□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 NLRP1Q9C000 1473 aa14.91□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.91□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.9□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MSC-AS1-210ENST00000524152 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 ABCC3O15438 1527 aa14.88□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.88□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.86□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.86□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 APLP2Q06481 763 aa14.86□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.85□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 KIF15Q9NS87 1388 aa14.85□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 ERVK-7P63135 1459 aa14.83□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.83□□□□□ -0.03
MSC-AS1-210ENST00000524152 CPS1P31327 1500 aa14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ILDR2Q71H61 639 aa14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ABCC5O15440 1437 aa14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 MED14O60244 1454 aa14.82□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.81□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ERBINQ96RT1 1412 aa14.81□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 DEPDC5O75140 1603 aa14.81□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 TOM1O60784 492 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 DAPK1P53355 1430 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.79□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
MSC-AS1-210ENST00000524152 PIP4K2BP78356 416 aa14.77□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 SOCS7O14512 581 aa14.76□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 KANK1Q14678 1352 aa14.75□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.75□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.75□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 CEP152O94986 1710 aa14.75□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 IQGAP1P46940 1657 aa14.74□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 HSPA1LP34931 641 aa14.74□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.74□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 LTKP29376 864 aa14.72□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.72□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 SLIT1O75093 1534 aa14.71□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.71□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 EID1Q9Y6B2 187 aa14.71□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.71□□□□□ -0.05
MSC-AS1-210ENST00000524152 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 LRRC7Q96NW7 1537 aa14.7□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM2Q9UHN6 1383 aa14.69□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 ADGRL2O95490 1459 aa14.68□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 ALKQ9UM73 1620 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 IDI1Q13907 227 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 SYNMO15061 1565 aa14.67□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 PIK3C2BO00750 1634 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 NOS1P29475 1434 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.65□□□□□ -0.06
MSC-AS1-210ENST00000524152 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.64□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 ADGRB3O60242 1522 aa14.6□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 KCNA6P17658 529 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.59□□□□□ -0.07
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM94Q12767 1356 aa14.58□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 TET3O43151 1660 aa14.57□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 ROCK1Q13464 1354 aa14.56□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 BCANQ96GW7 911 aa14.55□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZFYVE9O95405 1425 aa14.54□□□□□ -0.08
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms