RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521182.5

LY6E-210, Transcript of lymphocyte antigen 6 family member E, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LY6E, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6E-210ENST00000521182 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.06■■■□□ 2.24
LY6E-210ENST00000521182 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.01■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 PZPP20742 1482 aa29■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 PLA2R1Q13018 1463 aa29■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.98■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.96■■■□□ 2.23
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LY6E-210ENST00000521182 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.95■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.95■■■□□ 2.23
LY6E-210ENST00000521182 TNRQ92752 1358 aa28.95■■■□□ 2.22
LY6E-210ENST00000521182 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
LY6E-210ENST00000521182 ABCC5O15440 1437 aa28.94■■■□□ 2.22
LY6E-210ENST00000521182 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
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LY6E-210ENST00000521182 DAPK1P53355 1430 aa28.89■■■□□ 2.22
LY6E-210ENST00000521182 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.89■■■□□ 2.21
LY6E-210ENST00000521182 ERBINQ96RT1 1412 aa28.88■■■□□ 2.21
LY6E-210ENST00000521182 NLRP1Q9C000 1473 aa28.88■■■□□ 2.21
LY6E-210ENST00000521182 ABCC3O15438 1527 aa28.87■■■□□ 2.21
LY6E-210ENST00000521182 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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LY6E-210ENST00000521182 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.81■■■□□ 2.2
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LY6E-210ENST00000521182 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.78■■■□□ 2.2
LY6E-210ENST00000521182 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.77■■■□□ 2.2
LY6E-210ENST00000521182 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
LY6E-210ENST00000521182 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.77■■■□□ 2.2
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LY6E-210ENST00000521182 KANK1Q14678 1352 aa28.75■■■□□ 2.19
LY6E-210ENST00000521182 ERVK-7P63135 1459 aa28.74■■■□□ 2.19
LY6E-210ENST00000521182 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.72■■■□□ 2.19
LY6E-210ENST00000521182 ADGRL2O95490 1459 aa28.72■■■□□ 2.19
LY6E-210ENST00000521182 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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LY6E-210ENST00000521182 CEP152O94986 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 MED14O60244 1454 aa28.66■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.65■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.64■■■□□ 2.18
LY6E-210ENST00000521182 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.61■■■□□ 2.17
LY6E-210ENST00000521182 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
LY6E-210ENST00000521182 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.59■■■□□ 2.17
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LY6E-210ENST00000521182 EID1Q9Y6B2 187 aa28.5■■■□□ 2.15
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LY6E-210ENST00000521182 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
LY6E-210ENST00000521182 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.49■■■□□ 2.15
LY6E-210ENST00000521182 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.48■■■□□ 2.15
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LY6E-210ENST00000521182 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
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LY6E-210ENST00000521182 LTKP29376 864 aa28.43■■■□□ 2.14
LY6E-210ENST00000521182 PIK3C2BO00750 1634 aa28.43■■■□□ 2.14
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LY6E-210ENST00000521182 SYNMO15061 1565 aa28.39■■■□□ 2.14
LY6E-210ENST00000521182 TET3O43151 1660 aa28.38■■■□□ 2.13
LY6E-210ENST00000521182 UNC13BO14795 1591 aa28.38■■■□□ 2.13
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LY6E-210ENST00000521182 ITGAEP38570 1179 aa28.32■■■□□ 2.12
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LY6E-210ENST00000521182 NUP155O75694 1391 aa28.28■■■□□ 2.12
LY6E-210ENST00000521182 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.28■■■□□ 2.12
LY6E-210ENST00000521182 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.24■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 PIP4K2BP78356 416 aa28.23■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.23■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 KCNA6P17658 529 aa28.21■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 E9PCH4 1651 aa28.2■■■□□ 2.11
LY6E-210ENST00000521182 ZFYVE9O95405 1425 aa28.19■■■□□ 2.1
LY6E-210ENST00000521182 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.18■■■□□ 2.1
LY6E-210ENST00000521182 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.17■■■□□ 2.1
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