RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520948.5

VEGFA-222, Transcript of vascular endothelial growth factor A, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene VEGFA, Length 1,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEGFA-222	ENST00000520948	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.02	■■■□□ 2.08
VEGFA-222	ENST00000520948	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.01	■■■□□ 2.08
VEGFA-222	ENST00000520948	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	KIF3B	O15066	747 aa		28	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.99	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.98	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	PKD2	Q13563	968 aa		27.98	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		27.97	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.96	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		27.95	■■■□□ 2.07
VEGFA-222	ENST00000520948	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		27.95	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	PZP	P20742	1482 aa		27.92	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	TNR	Q92752	1358 aa		27.92	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.9	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		27.9	■■■□□ 2.06
VEGFA-222	ENST00000520948	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.89	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.87	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	TSPY4	P0CV99	314 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	TSPY10	P0CW01	314 aa		27.86	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.85	■■■□□ 2.05
VEGFA-222	ENST00000520948	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04	3e-7	■■□□□ 14.3
VEGFA-222	ENST00000520948	ABCC5	O15440	1437 aa		27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	ABCC3	O15438	1527 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	DAPK1	P53355	1430 aa		27.77	■■■□□ 2.04
VEGFA-222	ENST00000520948	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.75	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	CEP152	O94986	1710 aa		27.74	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		27.74	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.73	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.72	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	CPS1	P31327	1500 aa		27.72	■■■□□ 2.03
VEGFA-222	ENST00000520948	DEPDC5	O75140	1603 aa		27.7	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		27.69	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.68	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.67	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	SOCS7	O14512	581 aa		27.66	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.66	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	MED14	O60244	1454 aa		27.65	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.64	■■■□□ 2.02
VEGFA-222	ENST00000520948	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.62	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.61	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.6	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.59	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	TOM1	O60784	492 aa		27.58	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.58	■■■□□ 2.01
VEGFA-222	ENST00000520948	HSPA1L	P34931	641 aa		27.57	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.56	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	ITGAE	P38570	1179 aa		27.54	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.54	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.54	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.53	■■■□□ 2
VEGFA-222	ENST00000520948	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.51	■■□□□ 1.99	1e-14	■■■□□ 16.5
VEGFA-222	ENST00000520948	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	SYNM	O15061	1565 aa		27.49	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.49	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.48	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.47	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.45	■■□□□ 1.99
VEGFA-222	ENST00000520948	SLIT1	O75093	1534 aa		27.45	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	LTK	P29376	864 aa		27.44	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.42	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	KANK1	Q14678	1352 aa		27.42	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.4	■■□□□ 1.98
VEGFA-222	ENST00000520948	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.36	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		27.36	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	NAIP	Q13075	1403 aa		27.35	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.35	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.35	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.34	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.33	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.33	■■□□□ 1.97
VEGFA-222	ENST00000520948	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.32	■■□□□ 1.96
VEGFA-222	ENST00000520948	IDI1	Q13907	227 aa		27.3	■■□□□ 1.96
VEGFA-222	ENST00000520948	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.27	■■□□□ 1.96
VEGFA-222	ENST00000520948	NOS1	P29475	1434 aa		27.26	■■□□□ 1.95
VEGFA-222	ENST00000520948	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.26	■■□□□ 1.95
VEGFA-222	ENST00000520948	UNC13B	O14795	1591 aa		27.24	■■□□□ 1.95
VEGFA-222	ENST00000520948	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.22	■■□□□ 1.95
VEGFA-222	ENST00000520948	TET3	O43151	1660 aa		27.21	■■□□□ 1.95

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