RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 ILDR2Q71H61 639 aa23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.77■■□□□ 1.4
TSNARE1-206ENST00000520462 PTPRKQ15262 1439 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.76■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF3BO15066 747 aa23.73■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.72■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 DAPK1P53355 1430 aa23.71■■□□□ 1.39
TSNARE1-206ENST00000520462 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC5O15440 1437 aa23.7■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 PKD2Q13563 968 aa23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 PLA2R1Q13018 1463 aa23.67■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.65■■□□□ 1.38
TSNARE1-206ENST00000520462 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.63■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 TNRQ92752 1358 aa23.62■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF15Q9NS87 1388 aa23.61■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.6■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 PZPP20742 1482 aa23.58■■□□□ 1.37
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRL2O95490 1459 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-206ENST00000520462 ERBINQ96RT1 1412 aa23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1-206ENST00000520462 ITGAEP38570 1179 aa23.53■■□□□ 1.36
TSNARE1-206ENST00000520462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.48■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 NLRP1Q9C000 1473 aa23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.46■■□□□ 1.35
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC3O15438 1527 aa23.45■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 ROCK1Q13464 1354 aa23.44■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 CEP152O94986 1710 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.43■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 KANK1Q14678 1352 aa23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSNARE1-206ENST00000520462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
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TSNARE1-206ENST00000520462 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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TSNARE1-206ENST00000520462 ERVK-7P63135 1459 aa23.38■■□□□ 1.33
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TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TSNARE1-206ENST00000520462 TOM1O60784 492 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-206ENST00000520462 MED14O60244 1454 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-206ENST00000520462 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.34■■□□□ 1.33
TSNARE1-206ENST00000520462 IQGAP1P46940 1657 aa23.32■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPA1LP34931 641 aa23.29■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 UNC13BO14795 1591 aa23.28■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.27■■□□□ 1.32
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.26■■□□□ 1.31
TSNARE1-206ENST00000520462 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.24■■□□□ 1.31
TSNARE1-206ENST00000520462 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-206ENST00000520462 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSNARE1-206ENST00000520462 TET3O43151 1660 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-206ENST00000520462 LTKP29376 864 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-206ENST00000520462 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 HFM1A2PYH4 1435 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 NUP155O75694 1391 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 EID1Q9Y6B2 187 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 PIK3C2BO00750 1634 aa23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 SLIT1O75093 1534 aa23.18■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.17■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 SYNMO15061 1565 aa23.16■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 ALKQ9UM73 1620 aa23.15■■□□□ 1.3
TSNARE1-206ENST00000520462 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
TSNARE1-206ENST00000520462 IDI1Q13907 227 aa23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM52Q96A61 297 aa23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1-206ENST00000520462 E9PCH4 1651 aa23.12■■□□□ 1.29
TSNARE1-206ENST00000520462 NOS1P29475 1434 aa23.08■■□□□ 1.29
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