RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519842.1

HOXA7-202, Transcript of homeobox A7, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA7, Length 585 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7-202ENST00000519842 TSPY10P0CW01 314 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXA7-202ENST00000519842 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
HOXA7-202ENST00000519842 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXA7-202ENST00000519842 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 CEP152O94986 1710 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 APLP2Q06481 763 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 PTPRTO14522 1441 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 PZPP20742 1482 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 CERKQ8TCT0 537 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 ABCC5O15440 1437 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 ABCC3O15438 1527 aa29.2■■■□□ 2.27
HOXA7-202ENST00000519842 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.2■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.19■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 DAPK1P53355 1430 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 PLA2R1Q13018 1463 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 TNRQ92752 1358 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
HOXA7-202ENST00000519842 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
HOXA7-202ENST00000519842 KIF15Q9NS87 1388 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXA7-202ENST00000519842 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXA7-202ENST00000519842 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXA7-202ENST00000519842 DEPDC5O75140 1603 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 ERBINQ96RT1 1412 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 ERVK-7P63135 1459 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 NLRP1Q9C000 1473 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.01■■■□□ 2.24
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXA7-202ENST00000519842 PKD2Q13563 968 aa29■■■□□ 2.23
HOXA7-202ENST00000519842 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
HOXA7-202ENST00000519842 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXA7-202ENST00000519842 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 ADGRL2O95490 1459 aa28.95■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA7-202ENST00000519842 IQGAP1P46940 1657 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 PIK3C2BO00750 1634 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXA7-202ENST00000519842 KANK1Q14678 1352 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 SYNMO15061 1565 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 MED14O60244 1454 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.78■■■□□ 2.2
HOXA7-202ENST00000519842 UNC13BO14795 1591 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 CPS1P31327 1500 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 SLIT1O75093 1534 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 TET3O43151 1660 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
HOXA7-202ENST00000519842 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 NOS1P29475 1434 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 ADGRB3O60242 1522 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 LTKP29376 864 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 E9PCH4 1651 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 ITGAEP38570 1179 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA7-202ENST00000519842 ROCK1Q13464 1354 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 IDI1Q13907 227 aa28.62■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 ALKQ9UM73 1620 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.58■■■□□ 2.17
HOXA7-202ENST00000519842 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXA7-202ENST00000519842 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
HOXA7-202ENST00000519842 EID1Q9Y6B2 187 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 PIP4K2BP78356 416 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 ZFYVE9O95405 1425 aa28.45■■■□□ 2.15
HOXA7-202ENST00000519842 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 NUP155O75694 1391 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms