RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 PKD2Q13563 968 aa30.37■■■□□ 2.45
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CLDN23-201ENST00000519106 ABCA6Q8N139 1617 aa30.33■■■□□ 2.45
CLDN23-201ENST00000519106 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.33■■■□□ 2.45
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CLDN23-201ENST00000519106 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.29■■■□□ 2.44
CLDN23-201ENST00000519106 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.29■■■□□ 2.44
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CLDN23-201ENST00000519106 TONSLQ96HA7 1378 aa30.19■■■□□ 2.42
CLDN23-201ENST00000519106 KANK1Q14678 1352 aa30.18■■■□□ 2.42
CLDN23-201ENST00000519106 GGT6Q6P531 493 aa30.16■■■□□ 2.42
CLDN23-201ENST00000519106 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.16■■■□□ 2.42
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CLDN23-201ENST00000519106 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.12■■■□□ 2.41
CLDN23-201ENST00000519106 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.1■■■□□ 2.41
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CLDN23-201ENST00000519106 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.99■■■□□ 2.39
CLDN23-201ENST00000519106 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.98■■■□□ 2.39
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CLDN23-201ENST00000519106 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.96■■■□□ 2.39
CLDN23-201ENST00000519106 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.95■■■□□ 2.39
CLDN23-201ENST00000519106 ABCC3O15438 1527 aa29.95■■■□□ 2.38
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CLDN23-201ENST00000519106 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.91■■■□□ 2.38
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CLDN23-201ENST00000519106 MLECQ14165 292 aa29.89■■■□□ 2.38
CLDN23-201ENST00000519106 TRPM2O94759 1503 aa29.87■■■□□ 2.37
CLDN23-201ENST00000519106 NPATQ14207 1427 aa29.87■■■□□ 2.37
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CLDN23-201ENST00000519106 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
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CLDN23-201ENST00000519106 CLTCL1P53675 1640 aa29.8■■■□□ 2.36
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CLDN23-201ENST00000519106 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.78■■■□□ 2.36
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CLDN23-201ENST00000519106 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.72■■■□□ 2.35
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CLDN23-201ENST00000519106 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.64■■■□□ 2.34
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CLDN23-201ENST00000519106 PIK3C2BO00750 1634 aa29.57■■■□□ 2.32
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CLDN23-201ENST00000519106 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
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CLDN23-201ENST00000519106 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.45■■■□□ 2.31
CLDN23-201ENST00000519106 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.45■■■□□ 2.31
CLDN23-201ENST00000519106 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 MADDQ8WXG6 1647 aa29.44■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 IFT172Q9UG01 1749 aa29.43■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.42■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.42■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.42■■■□□ 2.3
CLDN23-201ENST00000519106 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.41■■■□□ 2.3
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