RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-204ENST00000518564 DAPK1P53355 1430 aa48.92■■■■■ 5.42
PPP2CB-204ENST00000518564 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.87■■■■■ 5.41
PPP2CB-204ENST00000518564 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
PPP2CB-204ENST00000518564 PTPRKQ15262 1439 aa48.83■■■■■ 5.41
PPP2CB-204ENST00000518564 KIF15Q9NS87 1388 aa48.8■■■■■ 5.4
PPP2CB-204ENST00000518564 MYO3AQ8NEV4 1616 aa48.8■■■■■ 5.4
PPP2CB-204ENST00000518564 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa48.79■■■■■ 5.4
PPP2CB-204ENST00000518564 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP48.72■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 ERBINQ96RT1 1412 aa48.71■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 STRCQ7RTU9 1775 aa48.7■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 PZPP20742 1482 aa48.7■■■■■ 5.39
PPP2CB-204ENST00000518564 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa48.69■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.68■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 MROH1Q8NDA8 1641 aa48.67■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCC3O15438 1527 aa48.65■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.64■■■■■ 5.38
PPP2CB-204ENST00000518564 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa48.59■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 DMRT2Q9Y5R5 561 aa48.59■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 CEP152O94986 1710 aa48.58■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 ADGRL2O95490 1459 aa48.57■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 NCOA1Q15788 1441 aa48.57■■■■■ 5.37
PPP2CB-204ENST00000518564 TNRQ92752 1358 aa48.56■■■■■ 5.36
PPP2CB-204ENST00000518564 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP48.53■■■■■ 5.36
PPP2CB-204ENST00000518564 DEPDC5O75140 1603 aa48.52■■■■■ 5.36
PPP2CB-204ENST00000518564 A2ML1A8K2U0 1454 aa48.51■■■■■ 5.36
PPP2CB-204ENST00000518564 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
PPP2CB-204ENST00000518564 PTPRTO14522 1441 aa48.45■■■■■ 5.35
PPP2CB-204ENST00000518564 PLA2R1Q13018 1463 aa48.45■■■■■ 5.35
PPP2CB-204ENST00000518564 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
PPP2CB-204ENST00000518564 KANK1Q14678 1352 aa48.42■■■■■ 5.34
PPP2CB-204ENST00000518564 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa48.4■■■■■ 5.34
PPP2CB-204ENST00000518564 NLRP1Q9C000 1473 aa48.4■■■■■ 5.34
PPP2CB-204ENST00000518564 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP48.39■■■■■ 5.34
PPP2CB-204ENST00000518564 ERVK-7P63135 1459 aa48.37■■■■■ 5.33
PPP2CB-204ENST00000518564 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa48.32■■■■■ 5.33
PPP2CB-204ENST00000518564 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.3■■■■■ 5.321e-9■■□□□ 13.8
PPP2CB-204ENST00000518564 PKD2Q13563 968 aa48.3■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa48.3■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa48.29■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 UGGT1Q9NYU2 1555 aa48.27■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 VWDEQ8N2E2 1590 aa48.26■■■■■ 5.32
PPP2CB-204ENST00000518564 LMTK2Q8IWU2 1503 aa48.25■■■■■ 5.31
PPP2CB-204ENST00000518564 ROCK1Q13464 1354 aa48.25■■■■■ 5.31
PPP2CB-204ENST00000518564 FBXO41Q8TF61 875 aa48.23■■■■■ 5.31
PPP2CB-204ENST00000518564 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
PPP2CB-204ENST00000518564 ITGAEP38570 1179 aa48.19■■■■■ 5.3
PPP2CB-204ENST00000518564 CERKQ8TCT0 537 aa48.19■■■■■ 5.3
PPP2CB-204ENST00000518564 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
PPP2CB-204ENST00000518564 EFCAB6Q5THR3 1501 aa48.14■■■■■ 5.3
PPP2CB-204ENST00000518564 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
PPP2CB-204ENST00000518564 UNC13BO14795 1591 aa48.1■■■■■ 5.29
PPP2CB-204ENST00000518564 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.07■■■■■ 5.29
PPP2CB-204ENST00000518564 UBR1Q8IWV7 1749 aa48.07■■■■■ 5.29
PPP2CB-204ENST00000518564 ANKLE2Q86XL3 938 aa48.04■■■■■ 5.28
PPP2CB-204ENST00000518564 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.03■■■■■ 5.28
PPP2CB-204ENST00000518564 TET3O43151 1660 aa48.02■■■■■ 5.28
PPP2CB-204ENST00000518564 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.97■■■■■ 5.27
PPP2CB-204ENST00000518564 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
PPP2CB-204ENST00000518564 PIK3C2BO00750 1634 aa47.96■■■■■ 5.27
PPP2CB-204ENST00000518564 SYNMO15061 1565 aa47.94■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 NOS1P29475 1434 aa47.91■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 IQGAP3Q86VI3 1631 aa47.91■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 MED14O60244 1454 aa47.91■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP47.9■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 IQGAP1P46940 1657 aa47.89■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.26
PPP2CB-204ENST00000518564 STAG3Q9UJ98 1225 aa47.86■■■■■ 5.25
PPP2CB-204ENST00000518564 IQSEC2Q5JU85 1478 aa47.84■■■■■ 5.25
PPP2CB-204ENST00000518564 SLIT1O75093 1534 aa47.84■■■■■ 5.25
PPP2CB-204ENST00000518564 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP47.81■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.81■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 NUP155O75694 1391 aa47.8■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 E9PCH4 1651 aa47.79■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 IDI1Q13907 227 aa47.78■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 ADGRB3O60242 1522 aa47.77■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 SLC52A1Q9NWF4 448 aa47.76■■■■■ 5.24
PPP2CB-204ENST00000518564 EID1Q9Y6B2 187 aa47.72■■■■■ 5.23
PPP2CB-204ENST00000518564 TMEM2Q9UHN6 1383 aa47.72■■■■■ 5.23
PPP2CB-204ENST00000518564 TXNDC2Q86VQ3 553 aa47.69■■■■■ 5.22
PPP2CB-204ENST00000518564 NAIPQ13075 1403 aa47.69■■■■■ 5.22
PPP2CB-204ENST00000518564 CPS1P31327 1500 aa47.69■■■■■ 5.22
PPP2CB-204ENST00000518564 LTKP29376 864 aa47.64■■■■■ 5.22
PPP2CB-204ENST00000518564 HFM1A2PYH4 1435 aa47.61■■■■■ 5.21
PPP2CB-204ENST00000518564 MYO5BQ9ULV0 1848 aa47.56■■■■■ 5.2
PPP2CB-204ENST00000518564 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa47.54■■■■■ 5.2
PPP2CB-204ENST00000518564 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa47.5■■■■■ 5.2
PPP2CB-204ENST00000518564 STRCP1A6NGW2 1772 aa47.46■■■■■ 5.19
PPP2CB-204ENST00000518564 CHGAP10645 457 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
PPP2CB-204ENST00000518564 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.43■■■■■ 5.18
PPP2CB-204ENST00000518564 ZFYVE9O95405 1425 aa47.4■■■■■ 5.18
PPP2CB-204ENST00000518564 RIMS2Q9UQ26 1411 aa47.39■■■■■ 5.18
PPP2CB-204ENST00000518564 TRIM52Q96A61 297 aa47.39■■■■■ 5.18
PPP2CB-204ENST00000518564 HDGFP51858 240 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
PPP2CB-204ENST00000518564 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP47.35■■■■■ 5.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms