RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM5CP41229 1560 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 DIP2BQ9P265 1576 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-228ENST00000515737 RAPGEF3O95398 923 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF3BO15066 747 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 DEPDC5O75140 1603 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-228ENST00000515737 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 TSPOAP1O95153 1857 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 A2MP01023 1474 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 PLA2R1Q13018 1463 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 KANK1Q14678 1352 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 RICTORQ6R327 1708 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCA6Q8N139 1617 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 E9PCH4 1651 aa23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 ATP10AO60312 1499 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.93■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 MIER1Q8N108 512 aa23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 TET3O43151 1660 aa23.91■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.9■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.89■■□□□ 1.42
SH3BP2-228ENST00000515737 RGL3Q3MIN7 710 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 GGT6Q6P531 493 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.86■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.84■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 PTPRTO14522 1441 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.83■■□□□ 1.41
SH3BP2-228ENST00000515737 TRPM2O94759 1503 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 CEP152O94986 1710 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.81■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.8■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-228ENST00000515737 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 CLTCL1P53675 1640 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC3O15438 1527 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 USP47Q96K76 1375 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-228ENST00000515737 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.71■■□□□ 1.39
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SH3BP2-228ENST00000515737 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.68■■□□□ 1.38
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SH3BP2-228ENST00000515737 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-228ENST00000515737 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-228ENST00000515737 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF1BO60333 1816 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 REREQ9P2R6 1566 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC7Q96M83 1385 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 STAC3Q96MF2 364 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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SH3BP2-228ENST00000515737 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 AGLP35573 1532 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-228ENST00000515737 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.58■■□□□ 1.36
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SH3BP2-228ENST00000515737 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 NOS1P29475 1434 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 MADDQ8WXG6 1647 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 ANP32CO43423 234 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 MROH2AA6NES4 1674 aa23.54■■□□□ 1.36
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SH3BP2-228ENST00000515737 MLECQ14165 292 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRB3O60242 1522 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 LAMC1P11047 1609 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 SYNMO15061 1565 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 IFT172Q9UG01 1749 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 PIK3C2BO00750 1634 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 MYOM2P54296 1465 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 IDI1Q13907 227 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.47■■□□□ 1.35
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