RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 DMRT2Q9Y5R5 561 aa17.16■□□□□ 0.34
ACTBP2-201ENST00000515712 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTBP2-201ENST00000515712 KIF15Q9NS87 1388 aa17.15■□□□□ 0.34
ACTBP2-201ENST00000515712 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCC5O15440 1437 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.14■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.13■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 ERBINQ96RT1 1412 aa17.12■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 KANK1Q14678 1352 aa17.11■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 PTPRKQ15262 1439 aa17.1■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
ACTBP2-201ENST00000515712 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 PZPP20742 1482 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 TNRQ92752 1358 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 NCOA1Q15788 1441 aa17.04■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCC3O15438 1527 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 ADGRL2O95490 1459 aa17.03■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
ACTBP2-201ENST00000515712 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.01■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 NLRP1Q9C000 1473 aa17■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 ITGAEP38570 1179 aa17■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 PKD2Q13563 968 aa17■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 PTPRTO14522 1441 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 PLA2R1Q13018 1463 aa16.99■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.98■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 MROH1Q8NDA8 1641 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP152O94986 1710 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 DEPDC5O75140 1603 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 ROCK1Q13464 1354 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 STRCQ7RTU9 1775 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTBP2-201ENST00000515712 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 ERVK-7P63135 1459 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 FBXO41Q8TF61 875 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 UGGT1Q9NYU2 1555 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.93■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.93■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 CERKQ8TCT0 537 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.91■□□□□ 0.3
ACTBP2-201ENST00000515712 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 EFCAB6Q5THR3 1501 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 VWDEQ8N2E2 1590 aa16.86■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 EID1Q9Y6B2 187 aa16.85■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 UNC13BO14795 1591 aa16.84■□□□□ 0.29
ACTBP2-201ENST00000515712 NUP155O75694 1391 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.83■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 TET3O43151 1660 aa16.81■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 UBR1Q8IWV7 1749 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 NOS1P29475 1434 aa16.79■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 MED14O60244 1454 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 PIK3C2BO00750 1634 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.78■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 IDI1Q13907 227 aa16.77■□□□□ 0.28
ACTBP2-201ENST00000515712 NEURL4Q96JN8 1562 aa16.77■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.76■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 SLIT1O75093 1534 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 IQGAP1P46940 1657 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 SYNMO15061 1565 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 ADGRB3O60242 1522 aa16.75■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIM52Q96A61 297 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 BCANQ96GW7 911 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 CPS1P31327 1500 aa16.74■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 NAIPQ13075 1403 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.73■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 HFM1A2PYH4 1435 aa16.72■□□□□ 0.27
ACTBP2-201ENST00000515712 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 E9PCH4 1651 aa16.7■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 LTKP29376 864 aa16.69■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 TOM1O60784 492 aa16.65■□□□□ 0.26
ACTBP2-201ENST00000515712 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms