RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.34■■■□□ 2.29
FAM53C-211ENST00000513056 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM53C-211ENST00000513056 NCOA2Q15596 1464 aa29.33■■■□□ 2.29
FAM53C-211ENST00000513056 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 PZPP20742 1482 aa29.31■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 SOCS7O14512 581 aa29.3■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.29■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 TNRQ92752 1358 aa29.27■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 KIF3BO15066 747 aa29.27■■■□□ 2.28
FAM53C-211ENST00000513056 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.25■■■□□ 2.27
FAM53C-211ENST00000513056 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.25■■■□□ 2.27
FAM53C-211ENST00000513056 CPS1P31327 1500 aa29.2■■■□□ 2.27
FAM53C-211ENST00000513056 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 NLRP1Q9C000 1473 aa29.2■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.2■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 MIA2Q96PC5 1412 aa29.17■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.16■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 TSPY4P0CV99 314 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 TSPY10P0CW01 314 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 DEPDC5O75140 1603 aa29.15■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.14■■■□□ 2.26
FAM53C-211ENST00000513056 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.13■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 MED14O60244 1454 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.12■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.11■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.1■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.09■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 ABCC3O15438 1527 aa29.08■■■□□ 2.25
FAM53C-211ENST00000513056 MAP3K1Q13233 1512 aa29.06■■■□□ 2.24
FAM53C-211ENST00000513056 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
FAM53C-211ENST00000513056 TOM1O60784 492 aa29.05■■■□□ 2.24
FAM53C-211ENST00000513056 IQGAP1P46940 1657 aa29.04■■■□□ 2.24
FAM53C-211ENST00000513056 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.02■■■□□ 2.24
FAM53C-211ENST00000513056 ERVK-7P63135 1459 aa29.01■■■□□ 2.23
FAM53C-211ENST00000513056 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.98■■■□□ 2.23
FAM53C-211ENST00000513056 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.96■■■□□ 2.23
FAM53C-211ENST00000513056 HSPA1LP34931 641 aa28.96■■■□□ 2.23
FAM53C-211ENST00000513056 CEP152O94986 1710 aa28.96■■■□□ 2.23
FAM53C-211ENST00000513056 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 ALKQ9UM73 1620 aa28.94■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 SYNMO15061 1565 aa28.94■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 PIP4K2BP78356 416 aa28.94■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.93■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.92■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
FAM53C-211ENST00000513056 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.89■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.88■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.88■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 ERBINQ96RT1 1412 aa28.86■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 SLIT1O75093 1534 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.85■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 KIF15Q9NS87 1388 aa28.83■■■□□ 2.21
FAM53C-211ENST00000513056 ABCC5O15440 1437 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM53C-211ENST00000513056 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM53C-211ENST00000513056 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.8■■■□□ 2.2
FAM53C-211ENST00000513056 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 PIK3C2BO00750 1634 aa28.73■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 LTKP29376 864 aa28.73■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 DAPK1P53355 1430 aa28.73■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.72■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.71■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.71■■■□□ 2.19
FAM53C-211ENST00000513056 KANK1Q14678 1352 aa28.7■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 EID1Q9Y6B2 187 aa28.69■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.69■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.68■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.65■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.65■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 APLP2Q06481 763 aa28.64■■■□□ 2.18
FAM53C-211ENST00000513056 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.172e-9■■■■■ 30.3
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FAM53C-211ENST00000513056 NOS1P29475 1434 aa28.59■■■□□ 2.17
FAM53C-211ENST00000513056 TET3O43151 1660 aa28.58■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 IDI1Q13907 227 aa28.57■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 ADGRL2O95490 1459 aa28.57■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 ADGRB3O60242 1522 aa28.56■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.56■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 KCNA6P17658 529 aa28.52■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.52■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 TMEM94Q12767 1356 aa28.51■■■□□ 2.16
FAM53C-211ENST00000513056 NWD1Q149M9 1564 aa28.51■■■□□ 2.15
FAM53C-211ENST00000513056 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
FAM53C-211ENST00000513056 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.5■■■□□ 2.15
FAM53C-211ENST00000513056 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
FAM53C-211ENST00000513056 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.45■■■□□ 2.14
FAM53C-211ENST00000513056 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.43■■■□□ 2.14
FAM53C-211ENST00000513056 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.43■■■□□ 2.14
FAM53C-211ENST00000513056 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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