RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-223ENST00000512131 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PLA2R1Q13018 1463 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 PKD2Q13563 968 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.72■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 SOCS7O14512 581 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TSPY4P0CV99 314 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 TSPY10P0CW01 314 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.71■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BP2-223ENST00000512131 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 ABCC5O15440 1437 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 DAPK1P53355 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SH3BP2-223ENST00000512131 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BP2-223ENST00000512131 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BP2-223ENST00000512131 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BP2-223ENST00000512131 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP2-223ENST00000512131 KIF3BO15066 747 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-223ENST00000512131 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
SH3BP2-223ENST00000512131 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BP2-223ENST00000512131 TNRQ92752 1358 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BP2-223ENST00000512131 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SH3BP2-223ENST00000512131 PZPP20742 1482 aa26.51■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 ADGRL2O95490 1459 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 KIF15Q9NS87 1388 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-223ENST00000512131 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 ERBINQ96RT1 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 CPS1P31327 1500 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 NLRP1Q9C000 1473 aa26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 ROCK1Q13464 1354 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 TOM1O60784 492 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-223ENST00000512131 HSPA1LP34931 641 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 PIP4K2BP78356 416 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 MED14O60244 1454 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-223ENST00000512131 DEPDC5O75140 1603 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-223ENST00000512131 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-223ENST00000512131 ABCC3O15438 1527 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-223ENST00000512131 ITGAEP38570 1179 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-223ENST00000512131 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-223ENST00000512131 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-223ENST00000512131 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-223ENST00000512131 ERVK-7P63135 1459 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-223ENST00000512131 ALKQ9UM73 1620 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-223ENST00000512131 IQGAP1P46940 1657 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-223ENST00000512131 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.784e-9■□□□□ 9.6
SH3BP2-223ENST00000512131 KANK1Q14678 1352 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 CEP152O94986 1710 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 NAIPQ13075 1403 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 UNC13BO14795 1591 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-223ENST00000512131 HFM1A2PYH4 1435 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 LTKP29376 864 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 SYNMO15061 1565 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.1■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 SLIT1O75093 1534 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-223ENST00000512131 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 EID1Q9Y6B2 187 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 NUP155O75694 1391 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 TET3O43151 1660 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-223ENST00000512131 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-223ENST00000512131 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-223ENST00000512131 NOS1P29475 1434 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-223ENST00000512131 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-223ENST00000512131 PIK3C2BO00750 1634 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-223ENST00000512131 IDI1Q13907 227 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-223ENST00000512131 E9PCH4 1651 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms