RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.2■■■□□ 2.43
CTBP1-211ENST00000511907 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CTBP1-211ENST00000511907 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.19■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.18■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC5O15440 1437 aa30.18■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 NCOA1Q15788 1441 aa30.18■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 FBXO41Q8TF61 875 aa30.17■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.16■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.15■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 DAPK1P53355 1430 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 PZPP20742 1482 aa30.14■■■□□ 2.42
CTBP1-211ENST00000511907 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 PTPRTO14522 1441 aa30.12■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.11■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 KIF15Q9NS87 1388 aa30.1■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 CEP152O94986 1710 aa30.1■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC3O15438 1527 aa30.09■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 TNRQ92752 1358 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 CERKQ8TCT0 537 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.08■■■□□ 2.41
CTBP1-211ENST00000511907 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.07■■■□□ 2.4
CTBP1-211ENST00000511907 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa30.05■■■□□ 2.4
CTBP1-211ENST00000511907 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-211ENST00000511907 PLA2R1Q13018 1463 aa30.04■■■□□ 2.4
CTBP1-211ENST00000511907 ERBINQ96RT1 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
CTBP1-211ENST00000511907 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.98■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 DEPDC5O75140 1603 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 PKD2Q13563 968 aa29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.95■■■□□ 2.39
CTBP1-211ENST00000511907 NLRP1Q9C000 1473 aa29.94■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 ERVK-7P63135 1459 aa29.93■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRL2O95490 1459 aa29.91■■■□□ 2.38
CTBP1-211ENST00000511907 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.86■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 KANK1Q14678 1352 aa29.85■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.82■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.81■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.8■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.78■■■□□ 2.36
CTBP1-211ENST00000511907 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.74■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.73■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 IQGAP1P46940 1657 aa29.72■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 PIK3C2BO00750 1634 aa29.71■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 MED14O60244 1454 aa29.7■■■□□ 2.35
CTBP1-211ENST00000511907 ITGAEP38570 1179 aa29.69■■■□□ 2.34
CTBP1-211ENST00000511907 SYNMO15061 1565 aa29.67■■■□□ 2.34
CTBP1-211ENST00000511907 UNC13BO14795 1591 aa29.66■■■□□ 2.34
CTBP1-211ENST00000511907 ROCK1Q13464 1354 aa29.65■■■□□ 2.34
CTBP1-211ENST00000511907 TET3O43151 1660 aa29.64■■■□□ 2.34
CTBP1-211ENST00000511907 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.62■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 SLIT1O75093 1534 aa29.61■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.61■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.6■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 NOS1P29475 1434 aa29.6■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 CPS1P31327 1500 aa29.6■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 IDI1Q13907 227 aa29.58■■■□□ 2.33
CTBP1-211ENST00000511907 LTKP29376 864 aa29.57■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.56■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.56■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.55■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.54■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRB3O60242 1522 aa29.54■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 E9PCH4 1651 aa29.53■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.53■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 EID1Q9Y6B2 187 aa29.52■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.52■■■□□ 2.32
CTBP1-211ENST00000511907 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.48■■■□□ 2.31
CTBP1-211ENST00000511907 NUP155O75694 1391 aa29.46■■■□□ 2.31
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.41■■■□□ 2.3
CTBP1-211ENST00000511907 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.4■■■□□ 2.3
CTBP1-211ENST00000511907 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
CTBP1-211ENST00000511907 TOM1O60784 492 aa29.36■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 PIP4K2BP78356 416 aa29.36■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 NAIPQ13075 1403 aa29.34■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms