RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
SH3BP2-220ENST00000511663 PLA2R1Q13018 1463 aa30.26■■■□□ 2.44
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 MIA2Q96PC5 1412 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 TNRQ92752 1358 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.23■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.22■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.21■■■□□ 2.43
SH3BP2-220ENST00000511663 PZPP20742 1482 aa30.19■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.18■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.14■■■□□ 2.42
SH3BP2-220ENST00000511663 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.41
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.12■■■□□ 2.41
SH3BP2-220ENST00000511663 NLRP1Q9C000 1473 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.42e-6■□□□□ 10.9
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC3O15438 1527 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF15Q9NS87 1388 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 DISP3Q9P2K9 1392 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCC5O15440 1437 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.391e-7■□□□□ 10.8
SH3BP2-220ENST00000511663 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-220ENST00000511663 DAPK1P53355 1430 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ERBINQ96RT1 1412 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 KANK1Q14678 1352 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVK-7P63135 1459 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 TOM1O60784 492 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 CPS1P31327 1500 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP2-220ENST00000511663 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP152O94986 1710 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 MED14O60244 1454 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 DEPDC5O75140 1603 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PIP4K2BP78356 416 aa29.83■■■□□ 2.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-220ENST00000511663 EID1Q9Y6B2 187 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP2-220ENST00000511663 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.8■■■□□ 2.36
SH3BP2-220ENST00000511663 IQGAP1P46940 1657 aa29.78■■■□□ 2.36
SH3BP2-220ENST00000511663 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP2-220ENST00000511663 ILDR2Q71H61 639 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP2-220ENST00000511663 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP2-220ENST00000511663 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
SH3BP2-220ENST00000511663 LTKP29376 864 aa29.72■■■□□ 2.35
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA1LP34931 641 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 IDI1Q13907 227 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 SLIT1O75093 1534 aa29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRL2O95490 1459 aa29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.66■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SOCS7O14512 581 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3C2BO00750 1634 aa29.62■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 BCANQ96GW7 911 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNMO15061 1565 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP2-220ENST00000511663 NOS1P29475 1434 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-220ENST00000511663 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-220ENST00000511663 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SH3BP2-220ENST00000511663 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.5■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNA6P17658 529 aa29.49■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ITGAEP38570 1179 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ROCK1Q13464 1354 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRB3O60242 1522 aa29.45■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
SH3BP2-220ENST00000511663 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
SH3BP2-220ENST00000511663 ALKQ9UM73 1620 aa29.44■■■□□ 2.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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