RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 KIF15Q9NS87 1388 aa27.8■■■□□ 2.04
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SH3BP2-214ENST00000509677 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
SH3BP2-214ENST00000509677 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.77■■■□□ 2.04
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SH3BP2-214ENST00000509677 MROH2AA6NES4 1674 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2-214ENST00000509677 NCOA1Q15788 1441 aa27.75■■■□□ 2.03
SH3BP2-214ENST00000509677 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.73■■■□□ 2.03
SH3BP2-214ENST00000509677 ADGRL2O95490 1459 aa27.71■■■□□ 2.03
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SH3BP2-214ENST00000509677 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.61■■■□□ 2.01
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SH3BP2-214ENST00000509677 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.59■■■□□ 2.014e-9■□□□□ 9.6
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SH3BP2-214ENST00000509677 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
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SH3BP2-214ENST00000509677 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.39■■□□□ 1.97
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SH3BP2-214ENST00000509677 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-214ENST00000509677 CEP152O94986 1710 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP2-214ENST00000509677 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP2-214ENST00000509677 NUP155O75694 1391 aa27.35■■□□□ 1.97
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SH3BP2-214ENST00000509677 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.31■■□□□ 1.96
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SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
SH3BP2-214ENST00000509677 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.27■■□□□ 1.96
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SH3BP2-214ENST00000509677 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.26■■□□□ 1.95
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SH3BP2-214ENST00000509677 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.26■■□□□ 1.95
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SH3BP2-214ENST00000509677 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-214ENST00000509677 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.22■■□□□ 1.95
SH3BP2-214ENST00000509677 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-214ENST00000509677 TET3O43151 1660 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-214ENST00000509677 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-214ENST00000509677 NLRP1Q9C000 1473 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP2-214ENST00000509677 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SH3BP2-214ENST00000509677 NOS1P29475 1434 aa27.16■■□□□ 1.94
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SH3BP2-214ENST00000509677 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.13■■□□□ 1.93
SH3BP2-214ENST00000509677 IDI1Q13907 227 aa27.11■■□□□ 1.93
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SH3BP2-214ENST00000509677 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-214ENST00000509677 SYNMO15061 1565 aa27.09■■□□□ 1.93
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.08■■□□□ 1.93
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SH3BP2-214ENST00000509677 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.02■■□□□ 1.92
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SH3BP2-214ENST00000509677 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
SH3BP2-214ENST00000509677 HRCP23327 699 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-214ENST00000509677 PIP4K2BP78356 416 aa26.98■■□□□ 1.91
SH3BP2-214ENST00000509677 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 ADGRB3O60242 1522 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 MED14O60244 1454 aa26.93■■□□□ 1.9
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SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.93■■□□□ 1.9
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